Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIN4Q56A73 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIN4Q56A73 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIN4Q56A73 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIN4Q56A73 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIN4Q56A73 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIN4Q56A73 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIN4Q56A73 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIN4Q56A73 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIN4Q56A73 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIN4Q56A73 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIN4Q56A73 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIN4Q56A73 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIN4Q56A73 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIN4Q56A73 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPIN4Q56A73 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SPIN4Q56A73 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPIN4Q56A73 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPIN4Q56A73 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIN4Q56A73 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIN4Q56A73 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPIN4Q56A73 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPIN4Q56A73 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPIN4Q56A73 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPIN4Q56A73 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPIN4Q56A73 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPIN4Q56A73 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPIN4Q56A73 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SPIN4Q56A73 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPIN4Q56A73 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SPIN4Q56A73 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPIN4Q56A73 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPIN4Q56A73 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPIN4Q56A73 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPIN4Q56A73 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPIN4Q56A73 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPIN4Q56A73 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPIN4Q56A73 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPIN4Q56A73 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPIN4Q56A73 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPIN4Q56A73 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPIN4Q56A73 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPIN4Q56A73 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPIN4Q56A73 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPIN4Q56A73 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPIN4Q56A73 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPIN4Q56A73 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPIN4Q56A73 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPIN4Q56A73 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SPIN4Q56A73 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPIN4Q56A73 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPIN4Q56A73 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPIN4Q56A73 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIN4Q56A73 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIN4Q56A73 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIN4Q56A73 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIN4Q56A73 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIN4Q56A73 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIN4Q56A73 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIN4Q56A73 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPIN4Q56A73 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPIN4Q56A73 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPIN4Q56A73 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPIN4Q56A73 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPIN4Q56A73 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPIN4Q56A73 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPIN4Q56A73 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPIN4Q56A73 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPIN4Q56A73 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIN4Q56A73 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms