Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SPIN4Q56A73 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SPIN4Q56A73 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
SPIN4Q56A73 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SPIN4Q56A73 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SPIN4Q56A73 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SPIN4Q56A73 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SPIN4Q56A73 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SPIN4Q56A73 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SPIN4Q56A73 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
SPIN4Q56A73 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SPIN4Q56A73 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SPIN4Q56A73 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SPIN4Q56A73 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SPIN4Q56A73 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SPIN4Q56A73 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPIN4Q56A73 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPIN4Q56A73 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SPIN4Q56A73 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPIN4Q56A73 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SPIN4Q56A73 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SPIN4Q56A73 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SPIN4Q56A73 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SPIN4Q56A73 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SPIN4Q56A73 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SPIN4Q56A73 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SPIN4Q56A73 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SPIN4Q56A73 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPIN4Q56A73 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SPIN4Q56A73 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SPIN4Q56A73 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPIN4Q56A73 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPIN4Q56A73 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPIN4Q56A73 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPIN4Q56A73 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPIN4Q56A73 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPIN4Q56A73 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPIN4Q56A73 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPIN4Q56A73 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SPIN4Q56A73 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPIN4Q56A73 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPIN4Q56A73 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPIN4Q56A73 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPIN4Q56A73 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPIN4Q56A73 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPIN4Q56A73 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPIN4Q56A73 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPIN4Q56A73 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPIN4Q56A73 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPIN4Q56A73 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPIN4Q56A73 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPIN4Q56A73 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPIN4Q56A73 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPIN4Q56A73 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPIN4Q56A73 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPIN4Q56A73 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPIN4Q56A73 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPIN4Q56A73 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPIN4Q56A73 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPIN4Q56A73 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPIN4Q56A73 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPIN4Q56A73 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPIN4Q56A73 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPIN4Q56A73 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPIN4Q56A73 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPIN4Q56A73 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPIN4Q56A73 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPIN4Q56A73 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPIN4Q56A73 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPIN4Q56A73 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPIN4Q56A73 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPIN4Q56A73 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPIN4Q56A73 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPIN4Q56A73 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPIN4Q56A73 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPIN4Q56A73 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SPIN4Q56A73 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPIN4Q56A73 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPIN4Q56A73 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPIN4Q56A73 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPIN4Q56A73 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPIN4Q56A73 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPIN4Q56A73 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPIN4Q56A73 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPIN4Q56A73 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SPIN4Q56A73 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPIN4Q56A73 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPIN4Q56A73 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPIN4Q56A73 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPIN4Q56A73 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPIN4Q56A73 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPIN4Q56A73 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPIN4Q56A73 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPIN4Q56A73 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPIN4Q56A73 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPIN4Q56A73 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPIN4Q56A73 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPIN4Q56A73 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPIN4Q56A73 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPIN4Q56A73 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms