Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SV2CQ496J9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SV2CQ496J9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SV2CQ496J9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SV2CQ496J9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SV2CQ496J9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SV2CQ496J9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SV2CQ496J9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SV2CQ496J9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SV2CQ496J9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SV2CQ496J9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SV2CQ496J9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SV2CQ496J9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SV2CQ496J9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SV2CQ496J9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.58■■■□□ 2
SV2CQ496J9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SV2CQ496J9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SV2CQ496J9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SV2CQ496J9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SV2CQ496J9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SV2CQ496J9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SV2CQ496J9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SV2CQ496J9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SV2CQ496J9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SV2CQ496J9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SV2CQ496J9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SV2CQ496J9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SV2CQ496J9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SV2CQ496J9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SV2CQ496J9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SV2CQ496J9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SV2CQ496J9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SV2CQ496J9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SV2CQ496J9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SV2CQ496J9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SV2CQ496J9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SV2CQ496J9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SV2CQ496J9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SV2CQ496J9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SV2CQ496J9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SV2CQ496J9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SV2CQ496J9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SV2CQ496J9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SV2CQ496J9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SV2CQ496J9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SV2CQ496J9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SV2CQ496J9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SV2CQ496J9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SV2CQ496J9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SV2CQ496J9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SV2CQ496J9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SV2CQ496J9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SV2CQ496J9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SV2CQ496J9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SV2CQ496J9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SV2CQ496J9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SV2CQ496J9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SV2CQ496J9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SV2CQ496J9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SV2CQ496J9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SV2CQ496J9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SV2CQ496J9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SV2CQ496J9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SV2CQ496J9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SV2CQ496J9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SV2CQ496J9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SV2CQ496J9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SV2CQ496J9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SV2CQ496J9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SV2CQ496J9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SV2CQ496J9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SV2CQ496J9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SV2CQ496J9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SV2CQ496J9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SV2CQ496J9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SV2CQ496J9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SV2CQ496J9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SV2CQ496J9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SV2CQ496J9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SV2CQ496J9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SV2CQ496J9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SV2CQ496J9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SV2CQ496J9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SV2CQ496J9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SV2CQ496J9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SV2CQ496J9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SV2CQ496J9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SV2CQ496J9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SV2CQ496J9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SV2CQ496J9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SV2CQ496J9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SV2CQ496J9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SV2CQ496J9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SV2CQ496J9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SV2CQ496J9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SV2CQ496J9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SV2CQ496J9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SV2CQ496J9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SV2CQ496J9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SV2CQ496J9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms