Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMN1Q16637 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMN1Q16637 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMN1Q16637 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMN1Q16637 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMN1Q16637 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMN1Q16637 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMN1Q16637 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMN1Q16637 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMN1Q16637 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMN1Q16637 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMN1Q16637 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMN1Q16637 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMN1Q16637 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMN1Q16637 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMN1Q16637 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMN1Q16637 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMN1Q16637 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMN1Q16637 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMN1Q16637 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMN1Q16637 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMN1Q16637 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMN1Q16637 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMN1Q16637 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMN1Q16637 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMN1Q16637 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMN1Q16637 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMN1Q16637 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMN1Q16637 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMN1Q16637 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMN1Q16637 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMN1Q16637 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMN1Q16637 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMN1Q16637 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMN1Q16637 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMN1Q16637 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMN1Q16637 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMN1Q16637 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMN1Q16637 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMN1Q16637 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMN1Q16637 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMN1Q16637 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMN1Q16637 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMN1Q16637 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SMN1Q16637 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMN1Q16637 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMN1Q16637 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMN1Q16637 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMN1Q16637 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMN1Q16637 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMN1Q16637 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMN1Q16637 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMN1Q16637 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMN1Q16637 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMN1Q16637 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMN1Q16637 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMN1Q16637 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMN1Q16637 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMN1Q16637 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMN1Q16637 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMN1Q16637 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMN1Q16637 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMN1Q16637 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMN1Q16637 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMN1Q16637 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
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