Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNMB1Q16558 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMB1Q16558 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMB1Q16558 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMB1Q16558 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNMB1Q16558 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNMB1Q16558 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNMB1Q16558 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNMB1Q16558 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNMB1Q16558 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNMB1Q16558 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMB1Q16558 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMB1Q16558 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMB1Q16558 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMB1Q16558 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMB1Q16558 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMB1Q16558 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMB1Q16558 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMB1Q16558 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMB1Q16558 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMB1Q16558 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMB1Q16558 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMB1Q16558 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMB1Q16558 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMB1Q16558 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMB1Q16558 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNMB1Q16558 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNMB1Q16558 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNMB1Q16558 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KCNMB1Q16558 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMB1Q16558 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMB1Q16558 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMB1Q16558 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMB1Q16558 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMB1Q16558 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMB1Q16558 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMB1Q16558 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMB1Q16558 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMB1Q16558 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMB1Q16558 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMB1Q16558 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMB1Q16558 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMB1Q16558 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMB1Q16558 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB1Q16558 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB1Q16558 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMB1Q16558 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB1Q16558 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMB1Q16558 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB1Q16558 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB1Q16558 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB1Q16558 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB1Q16558 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB1Q16558 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB1Q16558 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMB1Q16558 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB1Q16558 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB1Q16558 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB1Q16558 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMB1Q16558 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNMB1Q16558 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB1Q16558 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB1Q16558 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB1Q16558 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB1Q16558 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB1Q16558 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB1Q16558 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMB1Q16558 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB1Q16558 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB1Q16558 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB1Q16558 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMB1Q16558 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
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KCNMB1Q16558 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB1Q16558 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMB1Q16558 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMB1Q16558 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMB1Q16558 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMB1Q16558 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNMB1Q16558 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMB1Q16558 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMB1Q16558 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMB1Q16558 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMB1Q16558 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMB1Q16558 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMB1Q16558 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMB1Q16558 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMB1Q16558 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMB1Q16558 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMB1Q16558 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMB1Q16558 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMB1Q16558 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMB1Q16558 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMB1Q16558 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMB1Q16558 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMB1Q16558 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNMB1Q16558 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNMB1Q16558 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMB1Q16558 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMB1Q16558 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
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