Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

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Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KCNMB1Q16558 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KCNMB1Q16558 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNMB1Q16558 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNMB1Q16558 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNMB1Q16558 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNMB1Q16558 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNMB1Q16558 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNMB1Q16558 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNMB1Q16558 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNMB1Q16558 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNMB1Q16558 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNMB1Q16558 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNMB1Q16558 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNMB1Q16558 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNMB1Q16558 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNMB1Q16558 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNMB1Q16558 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNMB1Q16558 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNMB1Q16558 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNMB1Q16558 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNMB1Q16558 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNMB1Q16558 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNMB1Q16558 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNMB1Q16558 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNMB1Q16558 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNMB1Q16558 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNMB1Q16558 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNMB1Q16558 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNMB1Q16558 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNMB1Q16558 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNMB1Q16558 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNMB1Q16558 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNMB1Q16558 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNMB1Q16558 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNMB1Q16558 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNMB1Q16558 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNMB1Q16558 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNMB1Q16558 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNMB1Q16558 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNMB1Q16558 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNMB1Q16558 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNMB1Q16558 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNMB1Q16558 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNMB1Q16558 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNMB1Q16558 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNMB1Q16558 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNMB1Q16558 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KCNMB1Q16558 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNMB1Q16558 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNMB1Q16558 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNMB1Q16558 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNMB1Q16558 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNMB1Q16558 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNMB1Q16558 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNMB1Q16558 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNMB1Q16558 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNMB1Q16558 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNMB1Q16558 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNMB1Q16558 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNMB1Q16558 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNMB1Q16558 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNMB1Q16558 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNMB1Q16558 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNMB1Q16558 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNMB1Q16558 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNMB1Q16558 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNMB1Q16558 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNMB1Q16558 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNMB1Q16558 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNMB1Q16558 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNMB1Q16558 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNMB1Q16558 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNMB1Q16558 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNMB1Q16558 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNMB1Q16558 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNMB1Q16558 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNMB1Q16558 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNMB1Q16558 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNMB1Q16558 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNMB1Q16558 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNMB1Q16558 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNMB1Q16558 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNMB1Q16558 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNMB1Q16558 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNMB1Q16558 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNMB1Q16558 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNMB1Q16558 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNMB1Q16558 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNMB1Q16558 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNMB1Q16558 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNMB1Q16558 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNMB1Q16558 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNMB1Q16558 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNMB1Q16558 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNMB1Q16558 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNMB1Q16558 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNMB1Q16558 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNMB1Q16558 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNMB1Q16558 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
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