Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIP4Q15650 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIP4Q15650 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIP4Q15650 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIP4Q15650 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIP4Q15650 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIP4Q15650 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIP4Q15650 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIP4Q15650 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIP4Q15650 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIP4Q15650 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIP4Q15650 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIP4Q15650 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIP4Q15650 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIP4Q15650 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIP4Q15650 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIP4Q15650 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIP4Q15650 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIP4Q15650 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIP4Q15650 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIP4Q15650 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIP4Q15650 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIP4Q15650 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIP4Q15650 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIP4Q15650 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIP4Q15650 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIP4Q15650 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIP4Q15650 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIP4Q15650 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIP4Q15650 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIP4Q15650 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIP4Q15650 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIP4Q15650 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIP4Q15650 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIP4Q15650 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIP4Q15650 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIP4Q15650 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIP4Q15650 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIP4Q15650 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIP4Q15650 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIP4Q15650 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIP4Q15650 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIP4Q15650 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIP4Q15650 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIP4Q15650 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIP4Q15650 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIP4Q15650 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIP4Q15650 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIP4Q15650 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIP4Q15650 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIP4Q15650 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIP4Q15650 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIP4Q15650 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIP4Q15650 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIP4Q15650 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIP4Q15650 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIP4Q15650 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIP4Q15650 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIP4Q15650 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIP4Q15650 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIP4Q15650 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIP4Q15650 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIP4Q15650 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIP4Q15650 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIP4Q15650 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIP4Q15650 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIP4Q15650 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIP4Q15650 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIP4Q15650 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIP4Q15650 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIP4Q15650 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIP4Q15650 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIP4Q15650 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIP4Q15650 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIP4Q15650 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIP4Q15650 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIP4Q15650 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIP4Q15650 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIP4Q15650 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIP4Q15650 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIP4Q15650 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIP4Q15650 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIP4Q15650 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIP4Q15650 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIP4Q15650 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIP4Q15650 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms