Protein–RNA interactions for Protein: Q14191

WRN, Werner syndrome ATP-dependent helicase, humanhuman

Predicted RBP eCLIP

Length 1,432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WRNQ14191 PLEC-212ENST00000527816 583 ntTSL 323.42■■□□□ 1.341e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.331e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.331e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 SMG6-207ENST00000570756 2426 ntTSL 323.27■■□□□ 1.321e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.311e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 FES-211ENST00000464684 2461 ntTSL 523.17■■□□□ 1.31e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.291e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 TGIF2-203ENST00000557885 659 ntTSL 223.07■■□□□ 1.281e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.251e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.241e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.211e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.21e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.191e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.171e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.171e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.131e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.121e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.111e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.091e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 TRIT1-212ENST00000492612 983 ntTSL 521.87■■□□□ 1.091e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.071e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 PPP6R2-205ENST00000401672 2199 ntTSL 221.73■■□□□ 1.075e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 CIRBP-228ENST00000590347 3117 ntTSL 221.65■■□□□ 1.061e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.051e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 PHKG2-206ENST00000563913 1791 ntTSL 521.59■■□□□ 1.052e-12■■■■■ 58.5
WRNQ14191 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.055e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 BRCA1-225ENST00000586385 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.041e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 NIPA1-205ENST00000560069 575 ntTSL 421.55■■□□□ 1.041e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 TGIF2-207ENST00000561398 797 ntTSL 321.54■■□□□ 1.041e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.031e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 TRIT1-201ENST00000316891 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.021e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 SMG6-215ENST00000574501 2419 nt21.45■■□□□ 1.021e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.021e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.021e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.011e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 11e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.955e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.951e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.945e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 SLC12A7-206ENST00000634447 3142 ntTSL 520.75■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.891e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.891e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.881e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 CIRBP-242ENST00000593093 3528 ntTSL 220.53■□□□□ 0.881e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.871e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.861e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 TRIT1-215ENST00000541099 545 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.861e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.841e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.841e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.831e-6■■■■■ 58.5
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WRNQ14191 SFXN5-202ENST00000410065 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.81e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.81e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 POLR2J3-211ENST00000506060 793 ntTSL 319.93■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 TRIT1-205ENST00000462797 2000 ntTSL 519.91■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 XPC-205ENST00000476581 2944 ntTSL 1 (best)19.9■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 FAM71F2-207ENST00000641987 1582 nt19.88■□□□□ 0.771e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 PHKG2-210ENST00000569684 1134 ntTSL 519.81■□□□□ 0.762e-12■■■■■ 58.5
WRNQ14191 PIK3C2A-205ENST00000533645 2101 ntTSL 519.68■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 CIRBP-236ENST00000592051 573 ntTSL 419.54■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 TRIT1-213ENST00000495175 1156 ntTSL 1 (best)19.39■□□□□ 0.691e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 ZNF789-209ENST00000483089 2994 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.691e-6■■■■■ 58.5
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WRNQ14191 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.642e-12■■■■■ 58.5
WRNQ14191 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 POLR2J3-221ENST00000621093 348 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 POLR2J3-214ENST00000508910 575 ntTSL 418.49■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 POLR2J3-213ENST00000508848 1030 ntTSL 518.46■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 WDR20-210ENST00000556511 2117 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 SFXN5-207ENST00000461352 3578 ntTSL 1 (best)18.29■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 PPP6R2-201ENST00000216061 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.495e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.471e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.471e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 MROH1-211ENST00000544576 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 FAM71F2-202ENST00000477515 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 FAM71F2-201ENST00000474069 903 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 NIPA1-206ENST00000560105 375 ntTSL 217.72■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 BRCA1-227ENST00000591849 563 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 SFXN5-211ENST00000474528 4072 ntTSL 1 (best)17.37■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 WDR20-208ENST00000555973 560 ntTSL 417.34■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.361e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 FAM71F2-204ENST00000641443 820 nt17.29■□□□□ 0.361e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 KIAA1841-204ENST00000453186 4472 ntTSL 1 (best)17.25■□□□□ 0.351e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 WDR20-215ENST00000558448 611 ntTSL 317.24■□□□□ 0.351e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 TRIT1-211ENST00000491865 738 ntTSL 517.19■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 WDR20-207ENST00000555879 2175 ntTSL 217.05■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 ZNF142-207ENST00000450765 6028 ntTSL 1 (best)17.04■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 WDR20-218ENST00000559478 422 ntTSL 217.03■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 XPC-201ENST00000285021 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 58.5
WRNQ14191 FAM71F2-206ENST00000641888 1529 nt16.81■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 58.5
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