Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXE3Q13461 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FOXE3Q13461 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXE3Q13461 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXE3Q13461 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FOXE3Q13461 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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