Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTP4A2Q12974 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PTP4A2Q12974 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTP4A2Q12974 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTP4A2Q12974 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PTP4A2Q12974 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTP4A2Q12974 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTP4A2Q12974 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTP4A2Q12974 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTP4A2Q12974 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTP4A2Q12974 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTP4A2Q12974 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTP4A2Q12974 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTP4A2Q12974 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTP4A2Q12974 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTP4A2Q12974 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PTP4A2Q12974 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTP4A2Q12974 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTP4A2Q12974 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTP4A2Q12974 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTP4A2Q12974 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTP4A2Q12974 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTP4A2Q12974 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTP4A2Q12974 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTP4A2Q12974 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTP4A2Q12974 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTP4A2Q12974 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTP4A2Q12974 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTP4A2Q12974 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTP4A2Q12974 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTP4A2Q12974 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTP4A2Q12974 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTP4A2Q12974 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PTP4A2Q12974 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTP4A2Q12974 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTP4A2Q12974 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTP4A2Q12974 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTP4A2Q12974 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTP4A2Q12974 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTP4A2Q12974 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTP4A2Q12974 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTP4A2Q12974 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTP4A2Q12974 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTP4A2Q12974 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTP4A2Q12974 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTP4A2Q12974 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PTP4A2Q12974 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTP4A2Q12974 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTP4A2Q12974 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTP4A2Q12974 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTP4A2Q12974 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTP4A2Q12974 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTP4A2Q12974 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTP4A2Q12974 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTP4A2Q12974 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PTP4A2Q12974 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTP4A2Q12974 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTP4A2Q12974 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTP4A2Q12974 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTP4A2Q12974 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PTP4A2Q12974 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTP4A2Q12974 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTP4A2Q12974 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTP4A2Q12974 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTP4A2Q12974 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTP4A2Q12974 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTP4A2Q12974 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTP4A2Q12974 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTP4A2Q12974 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTP4A2Q12974 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTP4A2Q12974 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTP4A2Q12974 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTP4A2Q12974 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PTP4A2Q12974 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTP4A2Q12974 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTP4A2Q12974 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTP4A2Q12974 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTP4A2Q12974 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTP4A2Q12974 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTP4A2Q12974 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTP4A2Q12974 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PTP4A2Q12974 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTP4A2Q12974 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTP4A2Q12974 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PTP4A2Q12974 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTP4A2Q12974 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTP4A2Q12974 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTP4A2Q12974 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTP4A2Q12974 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTP4A2Q12974 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTP4A2Q12974 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTP4A2Q12974 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTP4A2Q12974 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTP4A2Q12974 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTP4A2Q12974 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTP4A2Q12974 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTP4A2Q12974 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTP4A2Q12974 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTP4A2Q12974 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
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