Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VLDLRP98155 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VLDLRP98155 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VLDLRP98155 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VLDLRP98155 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VLDLRP98155 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VLDLRP98155 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VLDLRP98155 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VLDLRP98155 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VLDLRP98155 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VLDLRP98155 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VLDLRP98155 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VLDLRP98155 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VLDLRP98155 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VLDLRP98155 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VLDLRP98155 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VLDLRP98155 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VLDLRP98155 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VLDLRP98155 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VLDLRP98155 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VLDLRP98155 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VLDLRP98155 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VLDLRP98155 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VLDLRP98155 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VLDLRP98155 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VLDLRP98155 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VLDLRP98155 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VLDLRP98155 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VLDLRP98155 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VLDLRP98155 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VLDLRP98155 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VLDLRP98155 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VLDLRP98155 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VLDLRP98155 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VLDLRP98155 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VLDLRP98155 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VLDLRP98155 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VLDLRP98155 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VLDLRP98155 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VLDLRP98155 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VLDLRP98155 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VLDLRP98155 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VLDLRP98155 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VLDLRP98155 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VLDLRP98155 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VLDLRP98155 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VLDLRP98155 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VLDLRP98155 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VLDLRP98155 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VLDLRP98155 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VLDLRP98155 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VLDLRP98155 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VLDLRP98155 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VLDLRP98155 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms