Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TMF1P82094 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TMF1P82094 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
TMF1P82094 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TMF1P82094 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TMF1P82094 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TMF1P82094 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TMF1P82094 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TMF1P82094 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TMF1P82094 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TMF1P82094 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TMF1P82094 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TMF1P82094 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
TMF1P82094 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TMF1P82094 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TMF1P82094 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TMF1P82094 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TMF1P82094 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TMF1P82094 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TMF1P82094 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TMF1P82094 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TMF1P82094 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TMF1P82094 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TMF1P82094 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TMF1P82094 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TMF1P82094 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TMF1P82094 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
TMF1P82094 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TMF1P82094 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TMF1P82094 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
TMF1P82094 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
TMF1P82094 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TMF1P82094 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TMF1P82094 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TMF1P82094 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TMF1P82094 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TMF1P82094 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TMF1P82094 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TMF1P82094 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TMF1P82094 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TMF1P82094 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TMF1P82094 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TMF1P82094 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TMF1P82094 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TMF1P82094 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TMF1P82094 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TMF1P82094 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TMF1P82094 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TMF1P82094 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TMF1P82094 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TMF1P82094 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TMF1P82094 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TMF1P82094 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TMF1P82094 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TMF1P82094 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TMF1P82094 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TMF1P82094 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TMF1P82094 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TMF1P82094 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TMF1P82094 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TMF1P82094 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TMF1P82094 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
TMF1P82094 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TMF1P82094 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TMF1P82094 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TMF1P82094 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TMF1P82094 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
TMF1P82094 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TMF1P82094 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TMF1P82094 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TMF1P82094 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TMF1P82094 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TMF1P82094 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
TMF1P82094 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TMF1P82094 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TMF1P82094 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TMF1P82094 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TMF1P82094 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TMF1P82094 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TMF1P82094 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TMF1P82094 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TMF1P82094 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TMF1P82094 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TMF1P82094 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
TMF1P82094 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TMF1P82094 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TMF1P82094 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TMF1P82094 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TMF1P82094 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TMF1P82094 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TMF1P82094 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TMF1P82094 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TMF1P82094 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TMF1P82094 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TMF1P82094 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TMF1P82094 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TMF1P82094 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TMF1P82094 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TMF1P82094 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TMF1P82094 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms