Protein–RNA interactions for Protein: P80192

MAP3K9, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K9P80192 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
MAP3K9P80192 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
MAP3K9P80192 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
MAP3K9P80192 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
MAP3K9P80192 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
MAP3K9P80192 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
MAP3K9P80192 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MAP3K9P80192 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MAP3K9P80192 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MAP3K9P80192 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MAP3K9P80192 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
MAP3K9P80192 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
MAP3K9P80192 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MAP3K9P80192 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
MAP3K9P80192 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MAP3K9P80192 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MAP3K9P80192 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MAP3K9P80192 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MAP3K9P80192 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MAP3K9P80192 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MAP3K9P80192 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
MAP3K9P80192 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MAP3K9P80192 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MAP3K9P80192 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
MAP3K9P80192 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
MAP3K9P80192 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MAP3K9P80192 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MAP3K9P80192 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
MAP3K9P80192 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MAP3K9P80192 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
MAP3K9P80192 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MAP3K9P80192 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MAP3K9P80192 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MAP3K9P80192 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MAP3K9P80192 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MAP3K9P80192 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
MAP3K9P80192 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MAP3K9P80192 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MAP3K9P80192 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
MAP3K9P80192 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
MAP3K9P80192 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
MAP3K9P80192 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
MAP3K9P80192 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MAP3K9P80192 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
MAP3K9P80192 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
MAP3K9P80192 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
MAP3K9P80192 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
MAP3K9P80192 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
MAP3K9P80192 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
MAP3K9P80192 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MAP3K9P80192 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
MAP3K9P80192 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MAP3K9P80192 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
MAP3K9P80192 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MAP3K9P80192 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MAP3K9P80192 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MAP3K9P80192 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MAP3K9P80192 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MAP3K9P80192 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MAP3K9P80192 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
MAP3K9P80192 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MAP3K9P80192 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MAP3K9P80192 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MAP3K9P80192 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
MAP3K9P80192 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MAP3K9P80192 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
MAP3K9P80192 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
MAP3K9P80192 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MAP3K9P80192 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MAP3K9P80192 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MAP3K9P80192 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MAP3K9P80192 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MAP3K9P80192 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MAP3K9P80192 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MAP3K9P80192 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MAP3K9P80192 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MAP3K9P80192 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MAP3K9P80192 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
MAP3K9P80192 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MAP3K9P80192 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MAP3K9P80192 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MAP3K9P80192 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MAP3K9P80192 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MAP3K9P80192 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MAP3K9P80192 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MAP3K9P80192 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MAP3K9P80192 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MAP3K9P80192 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
MAP3K9P80192 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MAP3K9P80192 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MAP3K9P80192 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MAP3K9P80192 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MAP3K9P80192 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MAP3K9P80192 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
MAP3K9P80192 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
MAP3K9P80192 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MAP3K9P80192 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
MAP3K9P80192 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MAP3K9P80192 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
MAP3K9P80192 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms