Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113P63121 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P63121 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P63121 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms