Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERV-K104P61576 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERV-K104P61576 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERV-K104P61576 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HERV-K104P61576 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HERV-K104P61576 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERV-K104P61576 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERV-K104P61576 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERV-K104P61576 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HERV-K104P61576 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERV-K104P61576 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERV-K104P61576 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HERV-K104P61576 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERV-K104P61576 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HERV-K104P61576 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERV-K104P61576 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERV-K104P61576 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERV-K104P61576 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERV-K104P61576 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERV-K104P61576 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERV-K104P61576 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERV-K104P61576 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HERV-K104P61576 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HERV-K104P61576 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERV-K104P61576 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERV-K104P61576 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERV-K104P61576 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HERV-K104P61576 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HERV-K104P61576 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HERV-K104P61576 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERV-K104P61576 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERV-K104P61576 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HERV-K104P61576 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERV-K104P61576 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERV-K104P61576 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HERV-K104P61576 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HERV-K104P61576 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERV-K104P61576 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERV-K104P61576 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERV-K104P61576 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HERV-K104P61576 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERV-K104P61576 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERV-K104P61576 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERV-K104P61576 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERV-K104P61576 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERV-K104P61576 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERV-K104P61576 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERV-K104P61576 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERV-K104P61576 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERV-K104P61576 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERV-K104P61576 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERV-K104P61576 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERV-K104P61576 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERV-K104P61576 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HERV-K104P61576 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERV-K104P61576 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERV-K104P61576 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERV-K104P61576 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERV-K104P61576 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERV-K104P61576 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERV-K104P61576 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERV-K104P61576 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERV-K104P61576 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERV-K104P61576 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERV-K104P61576 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERV-K104P61576 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERV-K104P61576 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERV-K104P61576 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERV-K104P61576 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERV-K104P61576 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERV-K104P61576 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERV-K104P61576 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERV-K104P61576 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERV-K104P61576 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERV-K104P61576 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERV-K104P61576 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERV-K104P61576 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms