Protein–RNA interactions for Protein: P59646

FXYD4, FXYD domain-containing ion transport regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD4P59646 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FXYD4P59646 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FXYD4P59646 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FXYD4P59646 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FXYD4P59646 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FXYD4P59646 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FXYD4P59646 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FXYD4P59646 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FXYD4P59646 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FXYD4P59646 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FXYD4P59646 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FXYD4P59646 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FXYD4P59646 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FXYD4P59646 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FXYD4P59646 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FXYD4P59646 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FXYD4P59646 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FXYD4P59646 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FXYD4P59646 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FXYD4P59646 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FXYD4P59646 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FXYD4P59646 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FXYD4P59646 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FXYD4P59646 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FXYD4P59646 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FXYD4P59646 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FXYD4P59646 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FXYD4P59646 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FXYD4P59646 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FXYD4P59646 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FXYD4P59646 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FXYD4P59646 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FXYD4P59646 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FXYD4P59646 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FXYD4P59646 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FXYD4P59646 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FXYD4P59646 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FXYD4P59646 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FXYD4P59646 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FXYD4P59646 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FXYD4P59646 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FXYD4P59646 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FXYD4P59646 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FXYD4P59646 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FXYD4P59646 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FXYD4P59646 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FXYD4P59646 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FXYD4P59646 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FXYD4P59646 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FXYD4P59646 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FXYD4P59646 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FXYD4P59646 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FXYD4P59646 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FXYD4P59646 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FXYD4P59646 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FXYD4P59646 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FXYD4P59646 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FXYD4P59646 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FXYD4P59646 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FXYD4P59646 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FXYD4P59646 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FXYD4P59646 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FXYD4P59646 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FXYD4P59646 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FXYD4P59646 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FXYD4P59646 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FXYD4P59646 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FXYD4P59646 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FXYD4P59646 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FXYD4P59646 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FXYD4P59646 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FXYD4P59646 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FXYD4P59646 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FXYD4P59646 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FXYD4P59646 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FXYD4P59646 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms