Protein–RNA interactions for Protein: P53990

IST1, IST1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IST1P53990 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IST1P53990 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IST1P53990 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IST1P53990 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IST1P53990 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IST1P53990 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IST1P53990 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IST1P53990 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IST1P53990 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IST1P53990 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IST1P53990 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IST1P53990 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IST1P53990 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IST1P53990 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IST1P53990 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IST1P53990 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IST1P53990 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IST1P53990 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IST1P53990 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IST1P53990 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IST1P53990 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IST1P53990 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IST1P53990 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IST1P53990 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IST1P53990 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IST1P53990 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IST1P53990 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IST1P53990 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IST1P53990 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IST1P53990 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IST1P53990 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IST1P53990 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IST1P53990 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IST1P53990 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IST1P53990 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IST1P53990 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IST1P53990 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IST1P53990 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IST1P53990 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IST1P53990 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
IST1P53990 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
IST1P53990 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IST1P53990 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IST1P53990 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IST1P53990 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IST1P53990 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IST1P53990 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IST1P53990 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IST1P53990 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IST1P53990 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IST1P53990 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IST1P53990 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IST1P53990 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IST1P53990 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IST1P53990 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IST1P53990 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IST1P53990 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IST1P53990 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IST1P53990 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IST1P53990 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IST1P53990 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IST1P53990 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IST1P53990 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IST1P53990 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IST1P53990 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IST1P53990 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IST1P53990 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IST1P53990 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IST1P53990 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IST1P53990 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IST1P53990 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IST1P53990 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IST1P53990 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IST1P53990 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IST1P53990 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IST1P53990 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IST1P53990 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IST1P53990 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IST1P53990 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IST1P53990 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IST1P53990 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IST1P53990 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IST1P53990 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IST1P53990 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IST1P53990 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IST1P53990 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IST1P53990 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IST1P53990 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IST1P53990 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IST1P53990 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IST1P53990 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IST1P53990 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IST1P53990 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IST1P53990 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IST1P53990 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IST1P53990 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IST1P53990 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IST1P53990 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IST1P53990 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IST1P53990 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms