Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC25A1P53007 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A1P53007 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A1P53007 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A1P53007 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A1P53007 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC25A1P53007 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC25A1P53007 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC25A1P53007 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC25A1P53007 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC25A1P53007 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC25A1P53007 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC25A1P53007 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC25A1P53007 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC25A1P53007 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC25A1P53007 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC25A1P53007 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC25A1P53007 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC25A1P53007 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC25A1P53007 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC25A1P53007 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC25A1P53007 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC25A1P53007 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC25A1P53007 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC25A1P53007 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC25A1P53007 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC25A1P53007 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC25A1P53007 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC25A1P53007 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC25A1P53007 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC25A1P53007 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC25A1P53007 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms