Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFNA3P52797 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EFNA3P52797 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFNA3P52797 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFNA3P52797 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFNA3P52797 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFNA3P52797 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFNA3P52797 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFNA3P52797 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFNA3P52797 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFNA3P52797 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFNA3P52797 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFNA3P52797 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EFNA3P52797 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFNA3P52797 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EFNA3P52797 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFNA3P52797 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFNA3P52797 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFNA3P52797 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFNA3P52797 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFNA3P52797 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFNA3P52797 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFNA3P52797 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFNA3P52797 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EFNA3P52797 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFNA3P52797 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFNA3P52797 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFNA3P52797 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFNA3P52797 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFNA3P52797 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFNA3P52797 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFNA3P52797 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFNA3P52797 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFNA3P52797 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFNA3P52797 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFNA3P52797 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
EFNA3P52797 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFNA3P52797 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EFNA3P52797 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFNA3P52797 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFNA3P52797 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFNA3P52797 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFNA3P52797 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EFNA3P52797 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFNA3P52797 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EFNA3P52797 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EFNA3P52797 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFNA3P52797 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EFNA3P52797 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFNA3P52797 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFNA3P52797 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFNA3P52797 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFNA3P52797 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFNA3P52797 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFNA3P52797 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFNA3P52797 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFNA3P52797 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFNA3P52797 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
EFNA3P52797 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EFNA3P52797 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms