Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBP50607 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBP50607 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBP50607 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBP50607 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TUBP50607 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TUBP50607 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUBP50607 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBP50607 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBP50607 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBP50607 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBP50607 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBP50607 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBP50607 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBP50607 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBP50607 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBP50607 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBP50607 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBP50607 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBP50607 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TUBP50607 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBP50607 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBP50607 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBP50607 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBP50607 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBP50607 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBP50607 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBP50607 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBP50607 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBP50607 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBP50607 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBP50607 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBP50607 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBP50607 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBP50607 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBP50607 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUBP50607 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TUBP50607 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBP50607 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBP50607 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBP50607 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBP50607 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBP50607 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBP50607 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBP50607 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBP50607 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBP50607 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBP50607 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBP50607 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBP50607 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBP50607 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBP50607 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBP50607 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBP50607 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBP50607 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBP50607 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBP50607 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBP50607 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBP50607 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBP50607 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBP50607 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBP50607 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBP50607 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBP50607 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBP50607 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBP50607 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBP50607 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBP50607 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBP50607 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBP50607 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBP50607 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBP50607 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBP50607 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBP50607 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBP50607 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBP50607 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBP50607 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBP50607 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBP50607 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBP50607 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBP50607 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBP50607 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBP50607 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBP50607 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBP50607 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBP50607 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBP50607 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TUBP50607 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBP50607 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBP50607 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBP50607 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBP50607 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBP50607 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBP50607 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBP50607 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBP50607 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBP50607 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBP50607 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBP50607 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBP50607 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms