Protein–RNA interactions for Protein: P49763

PGF, Placenta growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGFP49763 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PGFP49763 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PGFP49763 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PGFP49763 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PGFP49763 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PGFP49763 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PGFP49763 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PGFP49763 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PGFP49763 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PGFP49763 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PGFP49763 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PGFP49763 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PGFP49763 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PGFP49763 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PGFP49763 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PGFP49763 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PGFP49763 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PGFP49763 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PGFP49763 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PGFP49763 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PGFP49763 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PGFP49763 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PGFP49763 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PGFP49763 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PGFP49763 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PGFP49763 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PGFP49763 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PGFP49763 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PGFP49763 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PGFP49763 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PGFP49763 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PGFP49763 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PGFP49763 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PGFP49763 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PGFP49763 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PGFP49763 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PGFP49763 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PGFP49763 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PGFP49763 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PGFP49763 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PGFP49763 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGFP49763 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGFP49763 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGFP49763 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PGFP49763 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGFP49763 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGFP49763 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGFP49763 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGFP49763 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PGFP49763 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PGFP49763 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PGFP49763 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PGFP49763 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PGFP49763 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PGFP49763 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PGFP49763 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PGFP49763 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PGFP49763 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGFP49763 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGFP49763 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PGFP49763 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGFP49763 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PGFP49763 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PGFP49763 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PGFP49763 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PGFP49763 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PGFP49763 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGFP49763 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGFP49763 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGFP49763 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PGFP49763 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGFP49763 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGFP49763 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PGFP49763 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PGFP49763 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PGFP49763 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PGFP49763 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PGFP49763 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PGFP49763 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PGFP49763 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PGFP49763 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PGFP49763 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PGFP49763 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PGFP49763 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PGFP49763 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PGFP49763 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PGFP49763 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PGFP49763 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGFP49763 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGFP49763 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGFP49763 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PGFP49763 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGFP49763 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PGFP49763 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PGFP49763 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PGFP49763 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PGFP49763 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PGFP49763 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGFP49763 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGFP49763 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms