Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
ITGAEP38570 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
ITGAEP38570 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
ITGAEP38570 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC39.12■■■■□ 3.85
ITGAEP38570 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC39.11■■■■□ 3.85
ITGAEP38570 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
ITGAEP38570 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
ITGAEP38570 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
ITGAEP38570 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
ITGAEP38570 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
ITGAEP38570 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
ITGAEP38570 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
ITGAEP38570 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC39.08■■■■□ 3.85
ITGAEP38570 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ITGAEP38570 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC39.06■■■■□ 3.84
ITGAEP38570 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC39.06■■■■□ 3.84
ITGAEP38570 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
ITGAEP38570 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
ITGAEP38570 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
ITGAEP38570 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
ITGAEP38570 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
ITGAEP38570 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
ITGAEP38570 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
ITGAEP38570 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
ITGAEP38570 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
ITGAEP38570 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
ITGAEP38570 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
ITGAEP38570 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39■■■■□ 3.83
ITGAEP38570 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
ITGAEP38570 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
ITGAEP38570 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
ITGAEP38570 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
ITGAEP38570 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
ITGAEP38570 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
ITGAEP38570 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
ITGAEP38570 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
ITGAEP38570 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
ITGAEP38570 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
ITGAEP38570 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
ITGAEP38570 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
ITGAEP38570 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
ITGAEP38570 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
ITGAEP38570 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
ITGAEP38570 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
ITGAEP38570 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
ITGAEP38570 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.94■■■■□ 3.82
ITGAEP38570 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
ITGAEP38570 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
ITGAEP38570 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
ITGAEP38570 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
ITGAEP38570 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
ITGAEP38570 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
ITGAEP38570 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
ITGAEP38570 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
ITGAEP38570 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
ITGAEP38570 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
ITGAEP38570 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
ITGAEP38570 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
ITGAEP38570 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
ITGAEP38570 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
ITGAEP38570 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
ITGAEP38570 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
ITGAEP38570 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
ITGAEP38570 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
ITGAEP38570 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
ITGAEP38570 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
ITGAEP38570 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
ITGAEP38570 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC38.85■■■■□ 3.81
ITGAEP38570 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
ITGAEP38570 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
ITGAEP38570 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
ITGAEP38570 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
ITGAEP38570 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
ITGAEP38570 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
ITGAEP38570 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
ITGAEP38570 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
ITGAEP38570 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
ITGAEP38570 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
ITGAEP38570 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
ITGAEP38570 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
ITGAEP38570 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
ITGAEP38570 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
ITGAEP38570 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
ITGAEP38570 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
ITGAEP38570 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
ITGAEP38570 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
ITGAEP38570 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
ITGAEP38570 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
ITGAEP38570 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
ITGAEP38570 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ITGAEP38570 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
ITGAEP38570 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
ITGAEP38570 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ITGAEP38570 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ITGAEP38570 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
ITGAEP38570 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
ITGAEP38570 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
ITGAEP38570 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
ITGAEP38570 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
ITGAEP38570 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1161.5 ms