Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GJB2P29033 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GJB2P29033 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GJB2P29033 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GJB2P29033 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GJB2P29033 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GJB2P29033 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GJB2P29033 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GJB2P29033 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GJB2P29033 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GJB2P29033 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GJB2P29033 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GJB2P29033 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GJB2P29033 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GJB2P29033 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
GJB2P29033 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GJB2P29033 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GJB2P29033 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GJB2P29033 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GJB2P29033 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GJB2P29033 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
GJB2P29033 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GJB2P29033 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GJB2P29033 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GJB2P29033 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
GJB2P29033 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GJB2P29033 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GJB2P29033 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GJB2P29033 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GJB2P29033 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GJB2P29033 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GJB2P29033 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GJB2P29033 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GJB2P29033 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GJB2P29033 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GJB2P29033 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GJB2P29033 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GJB2P29033 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJB2P29033 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJB2P29033 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJB2P29033 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJB2P29033 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJB2P29033 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GJB2P29033 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GJB2P29033 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
GJB2P29033 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GJB2P29033 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GJB2P29033 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GJB2P29033 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GJB2P29033 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GJB2P29033 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GJB2P29033 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GJB2P29033 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GJB2P29033 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GJB2P29033 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GJB2P29033 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJB2P29033 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJB2P29033 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJB2P29033 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJB2P29033 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJB2P29033 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJB2P29033 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GJB2P29033 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GJB2P29033 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GJB2P29033 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GJB2P29033 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GJB2P29033 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GJB2P29033 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GJB2P29033 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJB2P29033 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
GJB2P29033 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJB2P29033 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJB2P29033 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GJB2P29033 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GJB2P29033 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GJB2P29033 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GJB2P29033 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
GJB2P29033 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GJB2P29033 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
GJB2P29033 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GJB2P29033 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GJB2P29033 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GJB2P29033 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GJB2P29033 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GJB2P29033 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GJB2P29033 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GJB2P29033 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
GJB2P29033 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
GJB2P29033 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GJB2P29033 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GJB2P29033 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GJB2P29033 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GJB2P29033 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GJB2P29033 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GJB2P29033 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GJB2P29033 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GJB2P29033 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GJB2P29033 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
GJB2P29033 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GJB2P29033 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms