Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
GJB2P29033 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.19■■■■□ 3.86
GJB2P29033 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
GJB2P29033 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
GJB2P29033 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
GJB2P29033 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
GJB2P29033 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
GJB2P29033 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.15■■■■□ 3.7
GJB2P29033 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
GJB2P29033 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
GJB2P29033 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
GJB2P29033 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
GJB2P29033 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
GJB2P29033 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
GJB2P29033 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
GJB2P29033 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
GJB2P29033 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
GJB2P29033 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
GJB2P29033 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
GJB2P29033 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
GJB2P29033 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
GJB2P29033 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
GJB2P29033 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
GJB2P29033 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
GJB2P29033 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
GJB2P29033 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
GJB2P29033 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
GJB2P29033 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
GJB2P29033 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
GJB2P29033 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
GJB2P29033 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
GJB2P29033 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.34
GJB2P29033 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
GJB2P29033 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
GJB2P29033 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
GJB2P29033 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
GJB2P29033 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
GJB2P29033 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
GJB2P29033 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
GJB2P29033 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
GJB2P29033 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
GJB2P29033 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
GJB2P29033 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
GJB2P29033 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
GJB2P29033 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
GJB2P29033 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
GJB2P29033 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
GJB2P29033 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
GJB2P29033 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
GJB2P29033 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
GJB2P29033 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
GJB2P29033 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
GJB2P29033 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
GJB2P29033 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
GJB2P29033 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
GJB2P29033 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
GJB2P29033 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
GJB2P29033 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
GJB2P29033 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
GJB2P29033 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
GJB2P29033 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
GJB2P29033 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GJB2P29033 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GJB2P29033 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
GJB2P29033 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GJB2P29033 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GJB2P29033 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GJB2P29033 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
GJB2P29033 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GJB2P29033 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GJB2P29033 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GJB2P29033 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GJB2P29033 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GJB2P29033 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GJB2P29033 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GJB2P29033 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GJB2P29033 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GJB2P29033 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GJB2P29033 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GJB2P29033 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GJB2P29033 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GJB2P29033 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GJB2P29033 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GJB2P29033 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GJB2P29033 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
GJB2P29033 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34■■■■□ 3.03
GJB2P29033 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
GJB2P29033 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GJB2P29033 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GJB2P29033 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
GJB2P29033 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GJB2P29033 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GJB2P29033 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GJB2P29033 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
GJB2P29033 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
GJB2P29033 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
GJB2P29033 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GJB2P29033 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
GJB2P29033 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GJB2P29033 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms