Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2F2P13984 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2F2P13984 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2F2P13984 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2F2P13984 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2F2P13984 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2F2P13984 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2F2P13984 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2F2P13984 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2F2P13984 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2F2P13984 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2F2P13984 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2F2P13984 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2F2P13984 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2F2P13984 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2F2P13984 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2F2P13984 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2F2P13984 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2F2P13984 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2F2P13984 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2F2P13984 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2F2P13984 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2F2P13984 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2F2P13984 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2F2P13984 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2F2P13984 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2F2P13984 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2F2P13984 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms