Protein–RNA interactions for Protein: P12956

XRCC6, X-ray repair cross-complementing protein 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 609 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC6P12956 STPG4-206ENST00000422269 983 ntTSL 212.52□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 32.2
XRCC6P12956 CALM2-202ENST00000409563 770 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 32.2
XRCC6P12956 CALM2-204ENST00000456319 703 ntTSL 25.75□□□□□ -1.492e-6■■■■■ 32.2
XRCC6P12956 GAK-202ENST00000502656 554 ntTSL 421.72■■□□□ 1.076e-7■■■■■ 32.2
XRCC6P12956 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.686e-7■■■■■ 32.2
XRCC6P12956 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.346e-7■■■■■ 32.2
XRCC6P12956 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.346e-7■■■■■ 32.2
XRCC6P12956 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.236e-7■■■■■ 32.2
XRCC6P12956 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.226e-7■■■■■ 32.2
XRCC6P12956 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.216e-7■■■■■ 32.2
XRCC6P12956 KDM6A-205ENST00000433797 4324 ntTSL 1 (best)8.07□□□□□ -1.126e-7■■■■■ 32.2
XRCC6P12956 KDM6A-203ENST00000414389 4189 ntTSL 55.46□□□□□ -1.546e-7■■■■■ 32.2
XRCC6P12956 RPS3-211ENST00000528847 639 ntTSL 511.08□□□□□ -0.645e-12■■■■■ 32.1
XRCC6P12956 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.664e-8■■■■■ 31.9
XRCC6P12956 TVP23C-CDRT4-204ENST00000557349 1005 ntTSL 218.62■□□□□ 0.574e-8■■■■■ 31.9
XRCC6P12956 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.354e-8■■■■■ 31.9
XRCC6P12956 TVP23C-208ENST00000581273 488 ntTSL 39.39□□□□□ -0.914e-8■■■■■ 31.9
XRCC6P12956 TVP23C-CDRT4-201ENST00000481756 556 ntTSL 46.36□□□□□ -1.394e-8■■■■■ 31.9
XRCC6P12956 TVP23C-CDRT4-202ENST00000518506 520 ntTSL 52.22□□□□□ -2.054e-8■■■■■ 31.9
XRCC6P12956 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.39□□□□□ -2.351e-24■■■■■ 31.8
XRCC6P12956 DLGAP4-AS1-201ENST00000425233 443 ntTSL 517.39■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 31.8
XRCC6P12956 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 31.8
XRCC6P12956 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.86e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.736e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.316e-11■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.246e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.26e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.996e-11■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 UBE2S-202ENST00000587845 743 ntTSL 226.44■■□□□ 1.826e-11■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 TCIRG1-214ENST00000533005 1655 ntTSL 526.26■■□□□ 1.796e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.636e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.596e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.556e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.466e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.236e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.176e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 GMDS-AS1-203ENST00000524770 565 ntTSL 322.34■■□□□ 1.176e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 GMDS-AS1-209ENST00000532124 629 ntTSL 422.34■■□□□ 1.176e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 TCIRG1-205ENST00000525724 1864 ntTSL 522.15■■□□□ 1.146e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 UQCR11-204ENST00000593029 533 ntTSL 222.06■■□□□ 1.126e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 AGAP3-209ENST00000469901 582 ntTSL 322.02■■□□□ 1.126e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 UQCR11-205ENST00000593264 409 ntTSL 321.63■■□□□ 1.056e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.056e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 AGAP3-207ENST00000467724 826 ntTSL 521.44■■□□□ 1.026e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.996e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 PRPF40A-209ENST00000486100 569 ntTSL 420.54■□□□□ 0.886e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.846e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 GMDS-AS1-206ENST00000530346 594 ntTSL 420.25■□□□□ 0.836e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.816e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 AGAP3-225ENST00000498559 581 ntTSL 220.02■□□□□ 0.86e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 EEF1G-203ENST00000525340 2496 ntTSL 1 (best)19.99■□□□□ 0.796e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 AP002990.1-201ENST00000526409 1954 ntTSL 519.5■□□□□ 0.716e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.676e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 HDAC7-227ENST00000548080 1479 ntTSL 519.23■□□□□ 0.676e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 TCIRG1-207ENST00000528981 755 ntTSL 519.02■□□□□ 0.646e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 PRPF40A-204ENST00000450303 496 ntTSL 318.86■□□□□ 0.616e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.576e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 HDAC7-217ENST00000459625 6414 ntTSL 217.98■□□□□ 0.476e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 PRPF40A-212ENST00000545856 1358 ntTSL 1 (best)17.96■□□□□ 0.476e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.446e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 UQCC1-219ENST00000491125 990 ntTSL 517.7■□□□□ 0.426e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 TCIRG1-208ENST00000529364 868 ntTSL 317.66■□□□□ 0.426e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 HDAC7-228ENST00000548938 2719 ntTSL 517.44■□□□□ 0.386e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 HDAC7-219ENST00000470668 4266 ntTSL 217.41■□□□□ 0.386e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 AGAP3-221ENST00000490097 604 ntTSL 416.93■□□□□ 0.36e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.36e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.286e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.226e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.216e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 HDAC7-221ENST00000477203 3122 ntTSL 216.1■□□□□ 0.176e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 PRPF40A-201ENST00000354363 1622 ntTSL 216.05■□□□□ 0.166e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 UQCC1-213ENST00000453855 1035 ntTSL 415.81■□□□□ 0.126e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 LAMA5-207ENST00000471042 487 ntTSL 215.78■□□□□ 0.126e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.116e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 PRPF40A-211ENST00000493468 1043 ntTSL 1 (best)15.71■□□□□ 0.116e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 HDAC7-230ENST00000552960 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.096e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 UQCC1-214ENST00000457259 1987 ntTSL 1 (best)15.59■□□□□ 0.096e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.056e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.056e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 AGAP3-214ENST00000476375 1019 ntTSL 514.81□□□□□ -0.046e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.056e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 UQCC1-206ENST00000374394 2329 ntTSL 214.61□□□□□ -0.076e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 UQCC1-203ENST00000374380 2133 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.076e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 UQCC1-201ENST00000349714 2188 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.086e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 SNAPC5-206ENST00000565465 1069 ntTSL 214.32□□□□□ -0.126e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 GMDS-AS1-208ENST00000531092 744 ntTSL 314.31□□□□□ -0.126e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 UQCC1-210ENST00000424405 758 ntTSL 514.27□□□□□ -0.136e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 PRPF40A-203ENST00000448428 490 ntTSL 514.22□□□□□ -0.136e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 SNAPC5-203ENST00000395589 749 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.176e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 SNAPC5-205ENST00000563480 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.176e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 SNAPC5-208ENST00000568875 1741 ntTSL 213.81□□□□□ -0.26e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 UQCC1-209ENST00000397556 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.236e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 SNAPC5-207ENST00000566658 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.236e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 HDAC7-226ENST00000547259 569 ntTSL 313.37□□□□□ -0.276e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 HPS4-202ENST00000398145 4497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.276e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 SNAPC5-202ENST00000316634 1002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.296e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 HPS4-214ENST00000485842 973 ntTSL 313.19□□□□□ -0.36e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 UQCC1-205ENST00000374385 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.316e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 UQCC1-202ENST00000359226 2036 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.316e-6■■■■■ 31.4
XRCC6P12956 SNAPC5-201ENST00000307979 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.326e-6■■■■■ 31.4
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