Protein–RNA interactions for Protein: P11844

CRYGA, Gamma-crystallin A, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYGAP11844 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRYGAP11844 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRYGAP11844 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CRYGAP11844 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRYGAP11844 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRYGAP11844 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRYGAP11844 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRYGAP11844 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRYGAP11844 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRYGAP11844 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYGAP11844 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYGAP11844 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYGAP11844 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYGAP11844 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYGAP11844 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYGAP11844 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYGAP11844 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYGAP11844 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYGAP11844 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYGAP11844 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRYGAP11844 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRYGAP11844 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRYGAP11844 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRYGAP11844 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms