Protein–RNA interactions for Protein: P11844

CRYGA, Gamma-crystallin A, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYGAP11844 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRYGAP11844 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRYGAP11844 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRYGAP11844 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRYGAP11844 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRYGAP11844 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRYGAP11844 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRYGAP11844 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRYGAP11844 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRYGAP11844 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRYGAP11844 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CRYGAP11844 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRYGAP11844 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CRYGAP11844 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRYGAP11844 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CRYGAP11844 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CRYGAP11844 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CRYGAP11844 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CRYGAP11844 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CRYGAP11844 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CRYGAP11844 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CRYGAP11844 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CRYGAP11844 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRYGAP11844 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CRYGAP11844 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CRYGAP11844 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRYGAP11844 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CRYGAP11844 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRYGAP11844 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRYGAP11844 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CRYGAP11844 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRYGAP11844 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CRYGAP11844 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CRYGAP11844 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CRYGAP11844 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRYGAP11844 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRYGAP11844 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRYGAP11844 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRYGAP11844 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CRYGAP11844 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRYGAP11844 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRYGAP11844 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CRYGAP11844 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CRYGAP11844 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CRYGAP11844 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRYGAP11844 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRYGAP11844 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRYGAP11844 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRYGAP11844 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRYGAP11844 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRYGAP11844 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRYGAP11844 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CRYGAP11844 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CRYGAP11844 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CRYGAP11844 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRYGAP11844 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CRYGAP11844 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRYGAP11844 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRYGAP11844 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRYGAP11844 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRYGAP11844 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CRYGAP11844 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CRYGAP11844 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CRYGAP11844 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CRYGAP11844 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CRYGAP11844 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CRYGAP11844 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRYGAP11844 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRYGAP11844 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRYGAP11844 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRYGAP11844 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRYGAP11844 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRYGAP11844 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRYGAP11844 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRYGAP11844 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYGAP11844 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRYGAP11844 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRYGAP11844 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRYGAP11844 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRYGAP11844 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRYGAP11844 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRYGAP11844 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRYGAP11844 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRYGAP11844 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRYGAP11844 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRYGAP11844 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRYGAP11844 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CRYGAP11844 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRYGAP11844 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRYGAP11844 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRYGAP11844 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRYGAP11844 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRYGAP11844 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRYGAP11844 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRYGAP11844 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRYGAP11844 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRYGAP11844 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRYGAP11844 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRYGAP11844 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRYGAP11844 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms