Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBP1P09455 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBP1P09455 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBP1P09455 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBP1P09455 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBP1P09455 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBP1P09455 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBP1P09455 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBP1P09455 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBP1P09455 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBP1P09455 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBP1P09455 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBP1P09455 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBP1P09455 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBP1P09455 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBP1P09455 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RBP1P09455 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBP1P09455 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBP1P09455 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBP1P09455 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBP1P09455 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBP1P09455 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBP1P09455 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RBP1P09455 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBP1P09455 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBP1P09455 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBP1P09455 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBP1P09455 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBP1P09455 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBP1P09455 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBP1P09455 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RBP1P09455 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBP1P09455 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBP1P09455 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBP1P09455 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBP1P09455 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBP1P09455 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBP1P09455 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBP1P09455 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBP1P09455 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBP1P09455 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBP1P09455 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBP1P09455 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBP1P09455 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBP1P09455 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBP1P09455 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBP1P09455 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RBP1P09455 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBP1P09455 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RBP1P09455 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBP1P09455 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBP1P09455 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBP1P09455 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RBP1P09455 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RBP1P09455 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBP1P09455 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBP1P09455 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBP1P09455 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBP1P09455 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBP1P09455 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBP1P09455 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBP1P09455 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBP1P09455 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RBP1P09455 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBP1P09455 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBP1P09455 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RBP1P09455 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBP1P09455 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBP1P09455 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBP1P09455 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBP1P09455 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBP1P09455 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBP1P09455 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RBP1P09455 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBP1P09455 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBP1P09455 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBP1P09455 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBP1P09455 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBP1P09455 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBP1P09455 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBP1P09455 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBP1P09455 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBP1P09455 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBP1P09455 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBP1P09455 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBP1P09455 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBP1P09455 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBP1P09455 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBP1P09455 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBP1P09455 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RBP1P09455 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBP1P09455 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBP1P09455 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBP1P09455 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBP1P09455 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBP1P09455 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBP1P09455 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBP1P09455 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBP1P09455 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBP1P09455 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms