Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLBP06746 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLBP06746 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLBP06746 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLBP06746 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLBP06746 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLBP06746 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLBP06746 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLBP06746 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLBP06746 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLBP06746 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLBP06746 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLBP06746 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLBP06746 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLBP06746 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLBP06746 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLBP06746 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLBP06746 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLBP06746 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLBP06746 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLBP06746 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLBP06746 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLBP06746 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLBP06746 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLBP06746 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLBP06746 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLBP06746 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLBP06746 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLBP06746 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLBP06746 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLBP06746 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLBP06746 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLBP06746 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLBP06746 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
POLBP06746 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLBP06746 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLBP06746 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLBP06746 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLBP06746 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLBP06746 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLBP06746 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLBP06746 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLBP06746 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLBP06746 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLBP06746 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLBP06746 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLBP06746 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLBP06746 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLBP06746 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLBP06746 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLBP06746 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLBP06746 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLBP06746 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLBP06746 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLBP06746 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLBP06746 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLBP06746 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLBP06746 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
POLBP06746 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
POLBP06746 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLBP06746 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLBP06746 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLBP06746 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLBP06746 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLBP06746 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
POLBP06746 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
POLBP06746 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLBP06746 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLBP06746 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLBP06746 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLBP06746 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLBP06746 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLBP06746 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLBP06746 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLBP06746 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLBP06746 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLBP06746 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLBP06746 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
POLBP06746 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLBP06746 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLBP06746 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLBP06746 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLBP06746 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLBP06746 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLBP06746 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLBP06746 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLBP06746 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLBP06746 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLBP06746 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLBP06746 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
POLBP06746 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLBP06746 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLBP06746 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLBP06746 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLBP06746 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLBP06746 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLBP06746 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLBP06746 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLBP06746 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLBP06746 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms