Protein–RNA interactions for Protein: P04436

T-cell receptor alpha chain V region HPB-MLT (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04436 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P04436 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
P04436 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P04436 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P04436 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P04436 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P04436 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P04436 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
P04436 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P04436 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P04436 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
P04436 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P04436 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P04436 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
P04436 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
P04436 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
P04436 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P04436 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P04436 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P04436 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P04436 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
P04436 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
P04436 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P04436 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P04436 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P04436 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P04436 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P04436 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P04436 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
P04436 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
P04436 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
P04436 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
P04436 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
P04436 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
P04436 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P04436 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P04436 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
P04436 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
P04436 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
P04436 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P04436 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P04436 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P04436 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P04436 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P04436 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P04436 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P04436 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P04436 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P04436 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P04436 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P04436 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P04436 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P04436 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P04436 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P04436 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P04436 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
P04436 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P04436 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
P04436 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P04436 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P04436 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P04436 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P04436 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P04436 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P04436 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
P04436 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P04436 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
P04436 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P04436 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
P04436 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P04436 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P04436 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P04436 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P04436 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P04436 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P04436 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
P04436 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
P04436 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P04436 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
P04436 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
P04436 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P04436 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P04436 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P04436 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
P04436 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P04436 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P04436 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
P04436 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
P04436 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P04436 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
P04436 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P04436 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P04436 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
P04436 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P04436 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P04436 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P04436 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
P04436 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
P04436 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P04436 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms