Protein–RNA interactions for Protein: P03897

MT-ND3, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND3P03897 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MT-ND3P03897 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MT-ND3P03897 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MT-ND3P03897 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MT-ND3P03897 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MT-ND3P03897 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MT-ND3P03897 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MT-ND3P03897 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MT-ND3P03897 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MT-ND3P03897 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MT-ND3P03897 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MT-ND3P03897 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MT-ND3P03897 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MT-ND3P03897 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MT-ND3P03897 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MT-ND3P03897 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MT-ND3P03897 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MT-ND3P03897 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MT-ND3P03897 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MT-ND3P03897 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MT-ND3P03897 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MT-ND3P03897 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MT-ND3P03897 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MT-ND3P03897 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MT-ND3P03897 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MT-ND3P03897 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MT-ND3P03897 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MT-ND3P03897 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MT-ND3P03897 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MT-ND3P03897 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MT-ND3P03897 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MT-ND3P03897 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MT-ND3P03897 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MT-ND3P03897 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MT-ND3P03897 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MT-ND3P03897 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MT-ND3P03897 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MT-ND3P03897 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MT-ND3P03897 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MT-ND3P03897 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MT-ND3P03897 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MT-ND3P03897 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MT-ND3P03897 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MT-ND3P03897 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MT-ND3P03897 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MT-ND3P03897 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MT-ND3P03897 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MT-ND3P03897 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MT-ND3P03897 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MT-ND3P03897 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MT-ND3P03897 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MT-ND3P03897 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MT-ND3P03897 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MT-ND3P03897 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MT-ND3P03897 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MT-ND3P03897 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MT-ND3P03897 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MT-ND3P03897 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MT-ND3P03897 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MT-ND3P03897 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MT-ND3P03897 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MT-ND3P03897 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MT-ND3P03897 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MT-ND3P03897 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MT-ND3P03897 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MT-ND3P03897 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MT-ND3P03897 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MT-ND3P03897 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MT-ND3P03897 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MT-ND3P03897 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MT-ND3P03897 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms