Protein–RNA interactions for Protein: P01772

IGHV3-33, Immunoglobulin heavy variable 3-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-33P01772 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGHV3-33P01772 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-33P01772 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHV3-33P01772 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGHV3-33P01772 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGHV3-33P01772 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGHV3-33P01772 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGHV3-33P01772 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGHV3-33P01772 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGHV3-33P01772 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGHV3-33P01772 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGHV3-33P01772 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGHV3-33P01772 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGHV3-33P01772 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGHV3-33P01772 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGHV3-33P01772 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IGHV3-33P01772 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IGHV3-33P01772 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IGHV3-33P01772 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IGHV3-33P01772 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IGHV3-33P01772 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IGHV3-33P01772 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IGHV3-33P01772 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IGHV3-33P01772 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IGHV3-33P01772 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IGHV3-33P01772 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IGHV3-33P01772 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms