Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCB11O95342 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCB11O95342 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCB11O95342 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ABCB11O95342 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCB11O95342 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCB11O95342 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCB11O95342 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCB11O95342 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCB11O95342 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCB11O95342 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCB11O95342 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCB11O95342 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCB11O95342 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCB11O95342 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCB11O95342 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCB11O95342 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCB11O95342 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCB11O95342 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCB11O95342 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCB11O95342 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCB11O95342 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCB11O95342 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCB11O95342 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCB11O95342 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCB11O95342 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ABCB11O95342 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCB11O95342 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCB11O95342 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCB11O95342 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCB11O95342 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCB11O95342 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCB11O95342 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCB11O95342 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCB11O95342 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCB11O95342 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ABCB11O95342 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCB11O95342 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCB11O95342 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCB11O95342 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCB11O95342 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCB11O95342 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCB11O95342 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCB11O95342 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCB11O95342 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCB11O95342 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCB11O95342 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCB11O95342 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCB11O95342 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCB11O95342 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCB11O95342 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCB11O95342 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCB11O95342 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCB11O95342 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCB11O95342 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCB11O95342 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCB11O95342 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCB11O95342 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCB11O95342 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCB11O95342 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCB11O95342 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCB11O95342 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCB11O95342 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCB11O95342 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCB11O95342 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCB11O95342 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCB11O95342 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms