Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAPBO95292 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAPBO95292 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAPBO95292 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAPBO95292 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAPBO95292 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAPBO95292 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAPBO95292 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAPBO95292 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAPBO95292 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAPBO95292 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VAPBO95292 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAPBO95292 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAPBO95292 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAPBO95292 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAPBO95292 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
VAPBO95292 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAPBO95292 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAPBO95292 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
VAPBO95292 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VAPBO95292 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VAPBO95292 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VAPBO95292 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VAPBO95292 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VAPBO95292 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAPBO95292 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAPBO95292 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VAPBO95292 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAPBO95292 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAPBO95292 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAPBO95292 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VAPBO95292 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAPBO95292 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAPBO95292 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAPBO95292 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VAPBO95292 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAPBO95292 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAPBO95292 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAPBO95292 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAPBO95292 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VAPBO95292 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAPBO95292 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAPBO95292 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAPBO95292 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VAPBO95292 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VAPBO95292 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VAPBO95292 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
VAPBO95292 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VAPBO95292 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAPBO95292 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAPBO95292 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VAPBO95292 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAPBO95292 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAPBO95292 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VAPBO95292 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAPBO95292 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAPBO95292 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VAPBO95292 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAPBO95292 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAPBO95292 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAPBO95292 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAPBO95292 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAPBO95292 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAPBO95292 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VAPBO95292 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VAPBO95292 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAPBO95292 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VAPBO95292 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAPBO95292 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAPBO95292 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAPBO95292 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAPBO95292 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VAPBO95292 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VAPBO95292 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAPBO95292 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VAPBO95292 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAPBO95292 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VAPBO95292 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAPBO95292 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAPBO95292 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAPBO95292 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VAPBO95292 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAPBO95292 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAPBO95292 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VAPBO95292 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAPBO95292 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VAPBO95292 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VAPBO95292 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAPBO95292 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAPBO95292 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAPBO95292 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAPBO95292 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VAPBO95292 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VAPBO95292 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VAPBO95292 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VAPBO95292 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAPBO95292 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAPBO95292 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAPBO95292 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAPBO95292 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms