Protein–RNA interactions for Protein: O95197

RTN3, Reticulon-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3O95197 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RTN3O95197 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTN3O95197 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTN3O95197 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTN3O95197 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTN3O95197 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RTN3O95197 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTN3O95197 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTN3O95197 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTN3O95197 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTN3O95197 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTN3O95197 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTN3O95197 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RTN3O95197 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTN3O95197 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTN3O95197 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTN3O95197 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTN3O95197 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTN3O95197 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTN3O95197 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTN3O95197 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTN3O95197 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTN3O95197 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RTN3O95197 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTN3O95197 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RTN3O95197 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RTN3O95197 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTN3O95197 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTN3O95197 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RTN3O95197 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTN3O95197 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTN3O95197 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTN3O95197 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTN3O95197 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTN3O95197 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTN3O95197 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTN3O95197 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTN3O95197 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTN3O95197 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTN3O95197 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTN3O95197 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTN3O95197 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RTN3O95197 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RTN3O95197 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RTN3O95197 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RTN3O95197 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RTN3O95197 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTN3O95197 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTN3O95197 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTN3O95197 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTN3O95197 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTN3O95197 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTN3O95197 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN3O95197 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN3O95197 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTN3O95197 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTN3O95197 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTN3O95197 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTN3O95197 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTN3O95197 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTN3O95197 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RTN3O95197 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
RTN3O95197 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RTN3O95197 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTN3O95197 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTN3O95197 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTN3O95197 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTN3O95197 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTN3O95197 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTN3O95197 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTN3O95197 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTN3O95197 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTN3O95197 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RTN3O95197 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTN3O95197 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RTN3O95197 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTN3O95197 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN3O95197 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN3O95197 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN3O95197 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN3O95197 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTN3O95197 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTN3O95197 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTN3O95197 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTN3O95197 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTN3O95197 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RTN3O95197 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTN3O95197 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTN3O95197 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTN3O95197 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTN3O95197 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTN3O95197 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTN3O95197 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTN3O95197 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTN3O95197 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTN3O95197 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTN3O95197 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTN3O95197 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTN3O95197 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTN3O95197 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms