Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPFIA2O75334 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PPFIA2O75334 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPFIA2O75334 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPFIA2O75334 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPFIA2O75334 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPFIA2O75334 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA2O75334 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA2O75334 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA2O75334 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPFIA2O75334 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPFIA2O75334 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA2O75334 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA2O75334 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA2O75334 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA2O75334 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA2O75334 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPFIA2O75334 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA2O75334 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA2O75334 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA2O75334 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA2O75334 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA2O75334 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPFIA2O75334 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIA2O75334 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPFIA2O75334 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA2O75334 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPFIA2O75334 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIA2O75334 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIA2O75334 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPFIA2O75334 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIA2O75334 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIA2O75334 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIA2O75334 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIA2O75334 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIA2O75334 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIA2O75334 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIA2O75334 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIA2O75334 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIA2O75334 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIA2O75334 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIA2O75334 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIA2O75334 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPFIA2O75334 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PPFIA2O75334 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPFIA2O75334 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PPFIA2O75334 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PPFIA2O75334 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPFIA2O75334 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIA2O75334 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIA2O75334 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIA2O75334 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIA2O75334 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA2O75334 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA2O75334 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA2O75334 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA2O75334 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA2O75334 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA2O75334 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA2O75334 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIA2O75334 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA2O75334 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA2O75334 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIA2O75334 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIA2O75334 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIA2O75334 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIA2O75334 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIA2O75334 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIA2O75334 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIA2O75334 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIA2O75334 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIA2O75334 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIA2O75334 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIA2O75334 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIA2O75334 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIA2O75334 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIA2O75334 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms