Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PPFIA2O75334 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PPFIA2O75334 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PPFIA2O75334 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PPFIA2O75334 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PPFIA2O75334 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
PPFIA2O75334 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PPFIA2O75334 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PPFIA2O75334 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PPFIA2O75334 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PPFIA2O75334 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PPFIA2O75334 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PPFIA2O75334 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PPFIA2O75334 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PPFIA2O75334 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PPFIA2O75334 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PPFIA2O75334 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PPFIA2O75334 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PPFIA2O75334 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PPFIA2O75334 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PPFIA2O75334 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PPFIA2O75334 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PPFIA2O75334 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PPFIA2O75334 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
PPFIA2O75334 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PPFIA2O75334 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PPFIA2O75334 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PPFIA2O75334 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PPFIA2O75334 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PPFIA2O75334 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PPFIA2O75334 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PPFIA2O75334 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PPFIA2O75334 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PPFIA2O75334 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PPFIA2O75334 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PPFIA2O75334 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PPFIA2O75334 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PPFIA2O75334 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PPFIA2O75334 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PPFIA2O75334 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PPFIA2O75334 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PPFIA2O75334 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PPFIA2O75334 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PPFIA2O75334 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PPFIA2O75334 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PPFIA2O75334 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PPFIA2O75334 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PPFIA2O75334 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PPFIA2O75334 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PPFIA2O75334 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PPFIA2O75334 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PPFIA2O75334 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PPFIA2O75334 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PPFIA2O75334 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PPFIA2O75334 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PPFIA2O75334 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PPFIA2O75334 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PPFIA2O75334 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PPFIA2O75334 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PPFIA2O75334 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PPFIA2O75334 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PPFIA2O75334 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PPFIA2O75334 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PPFIA2O75334 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PPFIA2O75334 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PPFIA2O75334 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PPFIA2O75334 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PPFIA2O75334 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PPFIA2O75334 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PPFIA2O75334 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PPFIA2O75334 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PPFIA2O75334 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PPFIA2O75334 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PPFIA2O75334 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PPFIA2O75334 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PPFIA2O75334 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PPFIA2O75334 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PPFIA2O75334 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PPFIA2O75334 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PPFIA2O75334 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PPFIA2O75334 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PPFIA2O75334 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PPFIA2O75334 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PPFIA2O75334 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PPFIA2O75334 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PPFIA2O75334 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PPFIA2O75334 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PPFIA2O75334 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PPFIA2O75334 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PPFIA2O75334 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PPFIA2O75334 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PPFIA2O75334 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PPFIA2O75334 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PPFIA2O75334 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PPFIA2O75334 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PPFIA2O75334 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PPFIA2O75334 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PPFIA2O75334 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PPFIA2O75334 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PPFIA2O75334 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms