Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATMINO43313 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATMINO43313 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATMINO43313 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATMINO43313 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATMINO43313 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATMINO43313 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ATMINO43313 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATMINO43313 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATMINO43313 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATMINO43313 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATMINO43313 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATMINO43313 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATMINO43313 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATMINO43313 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATMINO43313 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATMINO43313 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATMINO43313 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATMINO43313 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATMINO43313 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATMINO43313 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ATMINO43313 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ATMINO43313 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATMINO43313 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATMINO43313 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATMINO43313 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATMINO43313 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATMINO43313 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATMINO43313 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATMINO43313 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATMINO43313 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATMINO43313 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATMINO43313 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATMINO43313 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATMINO43313 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATMINO43313 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ATMINO43313 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATMINO43313 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATMINO43313 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATMINO43313 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATMINO43313 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ATMINO43313 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ATMINO43313 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATMINO43313 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATMINO43313 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATMINO43313 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATMINO43313 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATMINO43313 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATMINO43313 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATMINO43313 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATMINO43313 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATMINO43313 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATMINO43313 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATMINO43313 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATMINO43313 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATMINO43313 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATMINO43313 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATMINO43313 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ATMINO43313 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ATMINO43313 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATMINO43313 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATMINO43313 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATMINO43313 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATMINO43313 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATMINO43313 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATMINO43313 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATMINO43313 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATMINO43313 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATMINO43313 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATMINO43313 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATMINO43313 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ATMINO43313 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATMINO43313 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ATMINO43313 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATMINO43313 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATMINO43313 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATMINO43313 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATMINO43313 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATMINO43313 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATMINO43313 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATMINO43313 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATMINO43313 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATMINO43313 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATMINO43313 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATMINO43313 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATMINO43313 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATMINO43313 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATMINO43313 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATMINO43313 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATMINO43313 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ATMINO43313 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATMINO43313 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ATMINO43313 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATMINO43313 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ATMINO43313 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATMINO43313 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATMINO43313 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATMINO43313 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATMINO43313 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATMINO43313 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms