Protein–RNA interactions for Protein: O43173

ST8SIA3, Sia-alpha-2,3-Gal-beta-1,4-GlcNAc-R:alpha 2,8-sialyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST8SIA3O43173 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ST8SIA3O43173 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ST8SIA3O43173 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ST8SIA3O43173 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ST8SIA3O43173 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ST8SIA3O43173 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ST8SIA3O43173 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ST8SIA3O43173 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ST8SIA3O43173 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ST8SIA3O43173 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ST8SIA3O43173 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ST8SIA3O43173 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ST8SIA3O43173 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ST8SIA3O43173 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ST8SIA3O43173 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ST8SIA3O43173 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ST8SIA3O43173 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ST8SIA3O43173 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ST8SIA3O43173 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ST8SIA3O43173 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ST8SIA3O43173 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ST8SIA3O43173 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ST8SIA3O43173 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ST8SIA3O43173 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ST8SIA3O43173 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ST8SIA3O43173 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ST8SIA3O43173 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ST8SIA3O43173 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ST8SIA3O43173 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ST8SIA3O43173 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ST8SIA3O43173 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ST8SIA3O43173 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ST8SIA3O43173 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms