Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
H3BQF6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
H3BQF6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
H3BQF6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
H3BQF6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
H3BQF6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
H3BQF6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
H3BQF6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
H3BQF6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
H3BQF6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
H3BQF6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
H3BQF6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
H3BQF6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
H3BQF6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
H3BQF6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
H3BQF6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
H3BQF6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
H3BQF6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
H3BQF6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
H3BQF6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
H3BQF6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
H3BQF6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
H3BQF6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
H3BQF6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
H3BQF6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
H3BQF6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
H3BQF6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
H3BQF6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
H3BQF6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
H3BQF6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
H3BQF6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
H3BQF6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
H3BQF6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
H3BQF6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
H3BQF6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H3BQF6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
H3BQF6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
H3BQF6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
H3BQF6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
H3BQF6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
H3BQF6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H3BQF6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
H3BQF6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H3BQF6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
H3BQF6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H3BQF6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H3BQF6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H3BQF6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H3BQF6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
H3BQF6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
H3BQF6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
H3BQF6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
H3BQF6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
H3BQF6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
H3BQF6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
H3BQF6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
H3BQF6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
H3BQF6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
H3BQF6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
H3BQF6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
H3BQF6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
H3BQF6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
H3BQF6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
H3BQF6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
H3BQF6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
H3BQF6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H3BQF6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H3BQF6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H3BQF6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H3BQF6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
H3BQF6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
H3BQF6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
H3BQF6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
H3BQF6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
H3BQF6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
H3BQF6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
H3BQF6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
H3BQF6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
H3BQF6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
H3BQF6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
H3BQF6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
H3BQF6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
H3BQF6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
H3BQF6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
H3BQF6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
H3BQF6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
H3BQF6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
H3BQF6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
H3BQF6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
H3BQF6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
H3BQF6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
H3BQF6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
H3BQF6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
H3BQF6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
H3BQF6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
H3BQF6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
H3BQF6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
H3BQF6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
H3BQF6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
H3BQF6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms