Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN25C9JDP6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN25C9JDP6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN25C9JDP6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN25C9JDP6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN25C9JDP6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN25C9JDP6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN25C9JDP6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN25C9JDP6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN25C9JDP6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN25C9JDP6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN25C9JDP6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN25C9JDP6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN25C9JDP6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN25C9JDP6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN25C9JDP6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN25C9JDP6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN25C9JDP6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN25C9JDP6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN25C9JDP6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN25C9JDP6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN25C9JDP6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN25C9JDP6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN25C9JDP6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN25C9JDP6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN25C9JDP6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN25C9JDP6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN25C9JDP6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN25C9JDP6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN25C9JDP6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN25C9JDP6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN25C9JDP6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN25C9JDP6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLDN25C9JDP6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN25C9JDP6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN25C9JDP6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN25C9JDP6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN25C9JDP6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN25C9JDP6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN25C9JDP6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN25C9JDP6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN25C9JDP6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN25C9JDP6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN25C9JDP6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN25C9JDP6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN25C9JDP6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN25C9JDP6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN25C9JDP6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN25C9JDP6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN25C9JDP6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN25C9JDP6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN25C9JDP6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN25C9JDP6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN25C9JDP6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN25C9JDP6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN25C9JDP6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN25C9JDP6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN25C9JDP6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN25C9JDP6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN25C9JDP6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN25C9JDP6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CLDN25C9JDP6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN25C9JDP6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN25C9JDP6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN25C9JDP6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN25C9JDP6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN25C9JDP6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN25C9JDP6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN25C9JDP6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN25C9JDP6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN25C9JDP6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN25C9JDP6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms