Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
CLDN25C9JDP6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CLDN25C9JDP6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CLDN25C9JDP6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLDN25C9JDP6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLDN25C9JDP6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CLDN25C9JDP6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLDN25C9JDP6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLDN25C9JDP6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLDN25C9JDP6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLDN25C9JDP6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLDN25C9JDP6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLDN25C9JDP6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLDN25C9JDP6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLDN25C9JDP6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLDN25C9JDP6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLDN25C9JDP6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLDN25C9JDP6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLDN25C9JDP6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLDN25C9JDP6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLDN25C9JDP6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLDN25C9JDP6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLDN25C9JDP6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLDN25C9JDP6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLDN25C9JDP6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLDN25C9JDP6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLDN25C9JDP6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CLDN25C9JDP6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLDN25C9JDP6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLDN25C9JDP6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLDN25C9JDP6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLDN25C9JDP6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLDN25C9JDP6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLDN25C9JDP6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLDN25C9JDP6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CLDN25C9JDP6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLDN25C9JDP6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLDN25C9JDP6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLDN25C9JDP6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLDN25C9JDP6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLDN25C9JDP6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLDN25C9JDP6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CLDN25C9JDP6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLDN25C9JDP6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLDN25C9JDP6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLDN25C9JDP6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLDN25C9JDP6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLDN25C9JDP6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLDN25C9JDP6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLDN25C9JDP6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLDN25C9JDP6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLDN25C9JDP6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLDN25C9JDP6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLDN25C9JDP6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLDN25C9JDP6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLDN25C9JDP6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLDN25C9JDP6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLDN25C9JDP6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLDN25C9JDP6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLDN25C9JDP6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDN25C9JDP6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDN25C9JDP6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDN25C9JDP6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLDN25C9JDP6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLDN25C9JDP6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLDN25C9JDP6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLDN25C9JDP6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLDN25C9JDP6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLDN25C9JDP6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLDN25C9JDP6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLDN25C9JDP6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLDN25C9JDP6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLDN25C9JDP6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLDN25C9JDP6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLDN25C9JDP6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLDN25C9JDP6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLDN25C9JDP6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLDN25C9JDP6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLDN25C9JDP6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLDN25C9JDP6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLDN25C9JDP6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLDN25C9JDP6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLDN25C9JDP6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLDN25C9JDP6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLDN25C9JDP6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLDN25C9JDP6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLDN25C9JDP6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLDN25C9JDP6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLDN25C9JDP6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLDN25C9JDP6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLDN25C9JDP6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLDN25C9JDP6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLDN25C9JDP6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLDN25C9JDP6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLDN25C9JDP6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLDN25C9JDP6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLDN25C9JDP6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLDN25C9JDP6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLDN25C9JDP6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLDN25C9JDP6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms