Protein–RNA interactions for Protein: A0AVI4

TMEM129, E3 ubiquitin-protein ligase TM129, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM129A0AVI4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM129A0AVI4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM129A0AVI4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM129A0AVI4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM129A0AVI4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM129A0AVI4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM129A0AVI4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM129A0AVI4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM129A0AVI4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM129A0AVI4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM129A0AVI4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM129A0AVI4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM129A0AVI4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM129A0AVI4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM129A0AVI4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM129A0AVI4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM129A0AVI4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM129A0AVI4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM129A0AVI4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM129A0AVI4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM129A0AVI4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM129A0AVI4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM129A0AVI4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM129A0AVI4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM129A0AVI4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM129A0AVI4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM129A0AVI4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM129A0AVI4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM129A0AVI4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM129A0AVI4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM129A0AVI4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM129A0AVI4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM129A0AVI4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM129A0AVI4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM129A0AVI4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM129A0AVI4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM129A0AVI4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM129A0AVI4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM129A0AVI4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM129A0AVI4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM129A0AVI4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM129A0AVI4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM129A0AVI4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM129A0AVI4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM129A0AVI4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM129A0AVI4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM129A0AVI4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM129A0AVI4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM129A0AVI4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM129A0AVI4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM129A0AVI4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM129A0AVI4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM129A0AVI4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms