Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S3A2A0A539 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCRBV7S3A2A0A539 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCRBV7S3A2A0A539 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCRBV7S3A2A0A539 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCRBV7S3A2A0A539 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCRBV7S3A2A0A539 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCRBV7S3A2A0A539 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCRBV7S3A2A0A539 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCRBV7S3A2A0A539 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCRBV7S3A2A0A539 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCRBV7S3A2A0A539 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCRBV7S3A2A0A539 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TCRBV7S3A2A0A539 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TCRBV7S3A2A0A539 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TCRBV7S3A2A0A539 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TCRBV7S3A2A0A539 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCRBV7S3A2A0A539 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCRBV7S3A2A0A539 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCRBV7S3A2A0A539 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCRBV7S3A2A0A539 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TCRBV7S3A2A0A539 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCRBV7S3A2A0A539 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCRBV7S3A2A0A539 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCRBV7S3A2A0A539 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCRBV7S3A2A0A539 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCRBV7S3A2A0A539 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCRBV7S3A2A0A539 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCRBV7S3A2A0A539 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCRBV7S3A2A0A539 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCRBV7S3A2A0A539 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCRBV7S3A2A0A539 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCRBV7S3A2A0A539 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCRBV7S3A2A0A539 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCRBV7S3A2A0A539 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TCRBV7S3A2A0A539 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCRBV7S3A2A0A539 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCRBV7S3A2A0A539 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCRBV7S3A2A0A539 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCRBV7S3A2A0A539 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCRBV7S3A2A0A539 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCRBV7S3A2A0A539 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TCRBV7S3A2A0A539 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCRBV7S3A2A0A539 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCRBV7S3A2A0A539 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCRBV7S3A2A0A539 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCRBV7S3A2A0A539 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCRBV7S3A2A0A539 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCRBV7S3A2A0A539 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCRBV7S3A2A0A539 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCRBV7S3A2A0A539 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCRBV7S3A2A0A539 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCRBV7S3A2A0A539 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCRBV7S3A2A0A539 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCRBV7S3A2A0A539 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCRBV7S3A2A0A539 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCRBV7S3A2A0A539 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCRBV7S3A2A0A539 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCRBV7S3A2A0A539 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCRBV7S3A2A0A539 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCRBV7S3A2A0A539 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCRBV7S3A2A0A539 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TCRBV7S3A2A0A539 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TCRBV7S3A2A0A539 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCRBV7S3A2A0A539 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCRBV7S3A2A0A539 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCRBV7S3A2A0A539 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCRBV7S3A2A0A539 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TCRBV7S3A2A0A539 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
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