Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S3A2A0A539 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TCRBV7S3A2A0A539 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TCRBV7S3A2A0A539 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TCRBV7S3A2A0A539 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
TCRBV7S3A2A0A539 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TCRBV7S3A2A0A539 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
TCRBV7S3A2A0A539 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TCRBV7S3A2A0A539 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TCRBV7S3A2A0A539 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TCRBV7S3A2A0A539 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TCRBV7S3A2A0A539 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TCRBV7S3A2A0A539 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TCRBV7S3A2A0A539 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TCRBV7S3A2A0A539 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TCRBV7S3A2A0A539 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TCRBV7S3A2A0A539 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TCRBV7S3A2A0A539 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TCRBV7S3A2A0A539 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TCRBV7S3A2A0A539 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TCRBV7S3A2A0A539 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TCRBV7S3A2A0A539 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TCRBV7S3A2A0A539 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TCRBV7S3A2A0A539 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TCRBV7S3A2A0A539 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TCRBV7S3A2A0A539 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TCRBV7S3A2A0A539 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TCRBV7S3A2A0A539 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TCRBV7S3A2A0A539 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TCRBV7S3A2A0A539 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TCRBV7S3A2A0A539 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TCRBV7S3A2A0A539 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TCRBV7S3A2A0A539 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TCRBV7S3A2A0A539 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TCRBV7S3A2A0A539 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TCRBV7S3A2A0A539 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TCRBV7S3A2A0A539 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TCRBV7S3A2A0A539 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TCRBV7S3A2A0A539 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TCRBV7S3A2A0A539 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TCRBV7S3A2A0A539 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TCRBV7S3A2A0A539 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TCRBV7S3A2A0A539 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TCRBV7S3A2A0A539 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TCRBV7S3A2A0A539 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TCRBV7S3A2A0A539 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TCRBV7S3A2A0A539 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TCRBV7S3A2A0A539 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TCRBV7S3A2A0A539 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TCRBV7S3A2A0A539 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TCRBV7S3A2A0A539 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TCRBV7S3A2A0A539 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TCRBV7S3A2A0A539 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TCRBV7S3A2A0A539 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TCRBV7S3A2A0A539 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TCRBV7S3A2A0A539 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TCRBV7S3A2A0A539 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TCRBV7S3A2A0A539 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TCRBV7S3A2A0A539 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TCRBV7S3A2A0A539 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TCRBV7S3A2A0A539 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TCRBV7S3A2A0A539 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TCRBV7S3A2A0A539 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TCRBV7S3A2A0A539 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TCRBV7S3A2A0A539 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TCRBV7S3A2A0A539 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TCRBV7S3A2A0A539 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TCRBV7S3A2A0A539 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TCRBV7S3A2A0A539 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TCRBV7S3A2A0A539 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TCRBV7S3A2A0A539 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TCRBV7S3A2A0A539 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TCRBV7S3A2A0A539 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TCRBV7S3A2A0A539 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TCRBV7S3A2A0A539 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TCRBV7S3A2A0A539 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TCRBV7S3A2A0A539 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TCRBV7S3A2A0A539 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TCRBV7S3A2A0A539 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TCRBV7S3A2A0A539 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TCRBV7S3A2A0A539 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TCRBV7S3A2A0A539 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TCRBV7S3A2A0A539 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TCRBV7S3A2A0A539 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TCRBV7S3A2A0A539 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TCRBV7S3A2A0A539 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TCRBV7S3A2A0A539 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TCRBV7S3A2A0A539 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TCRBV7S3A2A0A539 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TCRBV7S3A2A0A539 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TCRBV7S3A2A0A539 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TCRBV7S3A2A0A539 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TCRBV7S3A2A0A539 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TCRBV7S3A2A0A539 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TCRBV7S3A2A0A539 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TCRBV7S3A2A0A539 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TCRBV7S3A2A0A539 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TCRBV7S3A2A0A539 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TCRBV7S3A2A0A539 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TCRBV7S3A2A0A539 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms