Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRBV2A0A0J9YWF9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV2A0A0J9YWF9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV2A0A0J9YWF9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV2A0A0J9YWF9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV2A0A0J9YWF9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV2A0A0J9YWF9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV2A0A0J9YWF9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV2A0A0J9YWF9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV2A0A0J9YWF9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV2A0A0J9YWF9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV2A0A0J9YWF9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV2A0A0J9YWF9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV2A0A0J9YWF9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV2A0A0J9YWF9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV2A0A0J9YWF9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV2A0A0J9YWF9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV2A0A0J9YWF9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV2A0A0J9YWF9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV2A0A0J9YWF9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV2A0A0J9YWF9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV2A0A0J9YWF9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV2A0A0J9YWF9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV2A0A0J9YWF9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV2A0A0J9YWF9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV2A0A0J9YWF9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV2A0A0J9YWF9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRBV2A0A0J9YWF9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRBV2A0A0J9YWF9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV2A0A0J9YWF9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV2A0A0J9YWF9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV2A0A0J9YWF9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV2A0A0J9YWF9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV2A0A0J9YWF9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV2A0A0J9YWF9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV2A0A0J9YWF9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRBV2A0A0J9YWF9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRBV2A0A0J9YWF9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRBV2A0A0J9YWF9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV2A0A0J9YWF9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV2A0A0J9YWF9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV2A0A0J9YWF9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV2A0A0J9YWF9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV2A0A0J9YWF9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV2A0A0J9YWF9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV2A0A0J9YWF9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV2A0A0J9YWF9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV2A0A0J9YWF9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
TRBV2A0A0J9YWF9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRBV2A0A0J9YWF9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRBV2A0A0J9YWF9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV2A0A0J9YWF9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV2A0A0J9YWF9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV2A0A0J9YWF9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV2A0A0J9YWF9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms