Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VBP1P61758 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VBP1P61758 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VBP1P61758 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VBP1P61758 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VBP1P61758 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VBP1P61758 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VBP1P61758 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VBP1P61758 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VBP1P61758 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VBP1P61758 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VBP1P61758 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VBP1P61758 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VBP1P61758 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VBP1P61758 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VBP1P61758 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VBP1P61758 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VBP1P61758 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VBP1P61758 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VBP1P61758 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VBP1P61758 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VBP1P61758 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VBP1P61758 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VBP1P61758 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VBP1P61758 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VBP1P61758 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VBP1P61758 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VBP1P61758 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VBP1P61758 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VBP1P61758 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VBP1P61758 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VBP1P61758 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VBP1P61758 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VBP1P61758 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VBP1P61758 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VBP1P61758 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VBP1P61758 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VBP1P61758 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VBP1P61758 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VBP1P61758 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VBP1P61758 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VBP1P61758 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VBP1P61758 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VBP1P61758 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VBP1P61758 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VBP1P61758 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VBP1P61758 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VBP1P61758 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VBP1P61758 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VBP1P61758 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VBP1P61758 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VBP1P61758 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VBP1P61758 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VBP1P61758 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VBP1P61758 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VBP1P61758 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VBP1P61758 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VBP1P61758 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VBP1P61758 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VBP1P61758 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VBP1P61758 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VBP1P61758 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VBP1P61758 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VBP1P61758 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VBP1P61758 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VBP1P61758 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VBP1P61758 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VBP1P61758 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VBP1P61758 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VBP1P61758 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms