Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 IL4R-202ENST00000395762 3685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.583e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 TADA2A-205ENST00000615182 4253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.623e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 LDLRAD3-206ENST00000534091 568 ntTSL 410.73□□□□□ -0.691e-7■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 DHCR24-202ENST00000436604 863 ntTSL 310.63□□□□□ -0.711e-38■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 TSC22D3-216ENST00000514426 569 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.713e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 AL355310.1-201ENST00000436416 596 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.83e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 ENO2-204ENST00000535275 724 ntTSL 39.97□□□□□ -0.813e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 AL669831.3-210ENST00000452176 818 ntTSL 1 (best)9.85□□□□□ -0.833e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 TADA2A-202ENST00000612272 1948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.843e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 CLDN12-202ENST00000394604 846 ntTSL 59.78□□□□□ -0.843e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 PNMA8A-202ENST00000438932 3335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.853e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 AC006153.1-201ENST00000480135 371 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.933e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 CLDN12-201ENST00000287916 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.973e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 TADA2A-210ENST00000619777 920 ntTSL 58.63□□□□□ -1.033e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 GNPAT-201ENST00000366647 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.043e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 GNPAT-205ENST00000492459 589 ntTSL 28.2□□□□□ -1.13e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 CLDN12-205ENST00000427904 618 ntTSL 38.14□□□□□ -1.113e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 LINC00923-204ENST00000614972 1181 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.134e-8■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 CLDN12-206ENST00000451941 527 ntTSL 37.69□□□□□ -1.183e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 CLDN12-210ENST00000483862 338 ntTSL 27.58□□□□□ -1.23e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.24e-8■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 TADA2A-211ENST00000620086 1096 ntTSL 57.44□□□□□ -1.223e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 HMGXB4-208ENST00000498325 867 ntTSL 37□□□□□ -1.293e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 TADA2A-206ENST00000615328 804 ntTSL 56.63□□□□□ -1.353e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.353e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 HMGXB4-205ENST00000464480 559 ntTSL 26.48□□□□□ -1.373e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 COMMD10-203ENST00000506589 793 ntTSL 56.46□□□□□ -1.384e-8■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.423e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 ARIH1-205ENST00000563310 4068 ntTSL 25.44□□□□□ -1.543e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 CLDN12-214ENST00000498033 420 ntTSL 35.23□□□□□ -1.573e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.853e-16■■■■■ 205
UTP3Q9NQZ2 SEPT9-242ENST00000592098 503 ntTSL 414.1□□□□□ -0.154e-7■■■■■ 204.9
UTP3Q9NQZ2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.177e-7■■■■■ 204.9
UTP3Q9NQZ2 EPN1-202ENST00000270460 16219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.667e-7■■■■■ 204.9
UTP3Q9NQZ2 IQSEC1-202ENST00000473088 545 ntTSL 417.79■□□□□ 0.441e-10■■■■■ 204.9
UTP3Q9NQZ2 RAB3GAP2-201ENST00000237724 821 ntTSL 316.27■□□□□ 0.28e-7■■■■■ 204.9
UTP3Q9NQZ2 RAB3GAP2-207ENST00000478976 575 ntTSL 410.92□□□□□ -0.668e-7■■■■■ 204.9
UTP3Q9NQZ2 RAB3GAP2-204ENST00000474178 539 ntTSL 410.46□□□□□ -0.738e-7■■■■■ 204.9
UTP3Q9NQZ2 SND1-208ENST00000470463 530 ntTSL 411.71□□□□□ -0.539e-7■■■■■ 204.6
UTP3Q9NQZ2 FHOD1-207ENST00000567752 4321 ntTSL 216.36■□□□□ 0.218e-11■■■■■ 204.6
UTP3Q9NQZ2 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.168e-11■■■■■ 204.6
UTP3Q9NQZ2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.571e-6■■■■■ 204.4
UTP3Q9NQZ2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.481e-6■■■■■ 204.3
UTP3Q9NQZ2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 204.3
UTP3Q9NQZ2 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 204.3
UTP3Q9NQZ2 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 204.3
UTP3Q9NQZ2 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 204.3
UTP3Q9NQZ2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.338e-21■■■■■ 204.3
UTP3Q9NQZ2 PKD1-203ENST00000423118 14135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.396e-7■■■■■ 204.3
UTP3Q9NQZ2 PKD1-201ENST00000262304 14138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.46e-7■■■■■ 204.3
UTP3Q9NQZ2 MIR922-201ENST00000401223 81 ntBASIC11.76□□□□□ -0.533e-31■■■■■ 204.1
UTP3Q9NQZ2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.561e-6■■■■■ 204
UTP3Q9NQZ2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.221e-6■■■■■ 204
UTP3Q9NQZ2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.061e-6■■■■■ 204
UTP3Q9NQZ2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.781e-6■■■■■ 204
UTP3Q9NQZ2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.721e-6■■■■■ 204
UTP3Q9NQZ2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.481e-6■■■■■ 204
UTP3Q9NQZ2 AC016876.2-201ENST00000581621 4554 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.371e-8■■■■■ 204
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF1-217ENST00000598812 588 ntTSL 521.01■□□□□ 0.952e-12■■■■■ 203.9
UTP3Q9NQZ2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.594e-8■■■■■ 203.7
UTP3Q9NQZ2 PDS5B-209ENST00000498550 4238 ntTSL 1 (best)3.39□□□□□ -1.875e-7■■■■■ 203.7
UTP3Q9NQZ2 PCYT1A-212ENST00000460677 1393 ntTSL 1 (best)17.07■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 203.6
UTP3Q9NQZ2 PCYT1A-211ENST00000444822 724 ntTSL 316.99■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 203.6
UTP3Q9NQZ2 PCYT1A-202ENST00000411591 1084 ntTSL 315.14■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 203.6
UTP3Q9NQZ2 PCYT1A-214ENST00000473978 1430 ntTSL 1 (best)13.41□□□□□ -0.261e-7■■■■■ 203.6
UTP3Q9NQZ2 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 203.6
UTP3Q9NQZ2 PCYT1A-216ENST00000491544 589 ntTSL 311.13□□□□□ -0.631e-7■■■■■ 203.6
UTP3Q9NQZ2 PCYT1A-210ENST00000443555 549 ntTSL 510.58□□□□□ -0.721e-7■■■■■ 203.6
UTP3Q9NQZ2 PCYT1A-203ENST00000412869 499 ntTSL 39.13□□□□□ -0.951e-7■■■■■ 203.6
UTP3Q9NQZ2 PCYT1A-208ENST00000438634 555 ntTSL 47.2□□□□□ -1.261e-7■■■■■ 203.6
UTP3Q9NQZ2 SUPT5H-211ENST00000598459 548 ntTSL 59.37□□□□□ -0.919e-7■■■■■ 203.5
UTP3Q9NQZ2 MIR4713HG-201ENST00000559909 561 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 203.5
UTP3Q9NQZ2 GCFC2-208ENST00000472230 2265 ntTSL 219.81■□□□□ 0.764e-7■■■■■ 203.4
UTP3Q9NQZ2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.434e-7■■■■■ 203.4
UTP3Q9NQZ2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.434e-7■■■■■ 203.4
UTP3Q9NQZ2 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.24e-7■■■■■ 203.4
UTP3Q9NQZ2 SNX29-205ENST00000566228 8171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.299e-7■■■■■ 203.4
UTP3Q9NQZ2 NEK2-203ENST00000462283 801 ntTSL 29.38□□□□□ -0.911e-10■■■■■ 203.4
UTP3Q9NQZ2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.497e-7■■■■■ 203.3
UTP3Q9NQZ2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.917e-7■■■■■ 203.3
UTP3Q9NQZ2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.87e-7■■■■■ 203.3
UTP3Q9NQZ2 AC073610.3-201ENST00000398092 939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.832e-7■■■■■ 203.3
UTP3Q9NQZ2 LIG1-204ENST00000542460 1527 ntTSL 218.37■□□□□ 0.532e-9■■■■■ 203.2
UTP3Q9NQZ2 BAIAP2-212ENST00000573017 574 ntTSL 49.68□□□□□ -0.867e-7■■■■■ 203.1
UTP3Q9NQZ2 BAIAP2-211ENST00000572918 626 ntTSL 46.95□□□□□ -1.37e-7■■■■■ 203.1
UTP3Q9NQZ2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.542e-8■■■■■ 203.1
UTP3Q9NQZ2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.52e-8■■■■■ 203.1
UTP3Q9NQZ2 GULP1-215ENST00000479019 1026 ntTSL 515.08■□□□□ 02e-8■■■■■ 203.1
UTP3Q9NQZ2 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.062e-8■■■■■ 203.1
UTP3Q9NQZ2 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.082e-8■■■■■ 203.1
UTP3Q9NQZ2 GULP1-208ENST00000409927 583 ntTSL 314.39□□□□□ -0.112e-8■■■■■ 203.1
UTP3Q9NQZ2 GULP1-201ENST00000359135 3347 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.642e-8■■■■■ 203.1
UTP3Q9NQZ2 GULP1-205ENST00000409805 983 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.92e-8■■■■■ 203.1
UTP3Q9NQZ2 GULP1-202ENST00000409580 3544 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.962e-8■■■■■ 203.1
UTP3Q9NQZ2 GULP1-203ENST00000409609 1932 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.042e-8■■■■■ 203.1
UTP3Q9NQZ2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.765e-7■■■■■ 203.1
UTP3Q9NQZ2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.645e-7■■■■■ 203.1
UTP3Q9NQZ2 TTC7B-202ENST00000553948 630 ntTSL 534.28■■■■□ 3.082e-7■■■■■ 203
UTP3Q9NQZ2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.842e-7■■■■■ 202.9
UTP3Q9NQZ2 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 202.9
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