RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553948.1

TTC7B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, humanhuman

TSL 5

Gene TTC7B, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7B-202ENST00000553948 NISCHQ9Y2I1 1504 aa80.01■■■■■ 10.4
TTC7B-202ENST00000553948 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa71.56■■■■■ 9.05
TTC7B-202ENST00000553948 ABCC9O60706 1549 aa70.94■■■■■ 8.95
TTC7B-202ENST00000553948 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa67.83■■■■■ 8.45
TTC7B-202ENST00000553948 NACADO15069 1562 aa67.51■■■■■ 8.4
TTC7B-202ENST00000553948 DCAF8L2P0C7V8 631 aa67.29■■■■■ 8.36
TTC7B-202ENST00000553948 MYO15BQ96JP2 1530 aa66.77■■■■■ 8.28
TTC7B-202ENST00000553948 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP66.43■■■■■ 8.22
TTC7B-202ENST00000553948 UNC13AQ9UPW8 1703 aa66.27■■■■■ 8.2
TTC7B-202ENST00000553948 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP66.14■■■■■ 8.18
TTC7B-202ENST00000553948 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa66.13■■■■■ 8.18
TTC7B-202ENST00000553948 DNAJC5BQ9UF47 199 aa65.96■■■■■ 8.15
TTC7B-202ENST00000553948 BICRAQ9NZM4 1560 aa65.79■■■■■ 8.12
TTC7B-202ENST00000553948 SCRIBQ14160 1630 aa65.23■■■■■ 8.03
TTC7B-202ENST00000553948 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa65.01■■■■■ 8
TTC7B-202ENST00000553948 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP64.14■■■■■ 7.86
TTC7B-202ENST00000553948 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa64.13■■■■■ 7.86
TTC7B-202ENST00000553948 CECR2Q9BXF3 1484 aa63.85■■■■■ 7.81
TTC7B-202ENST00000553948 NCAPD3P42695 1498 aa62.3■■■■■ 7.56
TTC7B-202ENST00000553948 SMARCA4P51532 1647 aa62.29■■■■■ 7.56
TTC7B-202ENST00000553948 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa62.19■■■■■ 7.55
TTC7B-202ENST00000553948 SMARCA2P51531 1590 aa62.08■■■■■ 7.53
TTC7B-202ENST00000553948 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP62.08■■■■■ 7.53
TTC7B-202ENST00000553948 HMGXB3Q12766 1538 aa61.9■■■■■ 7.5
TTC7B-202ENST00000553948 PEG3Q9GZU2 1588 aa61.68■■■■■ 7.46
TTC7B-202ENST00000553948 MROH2BQ7Z745 1585 aa61.65■■■■■ 7.46
TTC7B-202ENST00000553948 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP61.64■■■■■ 7.46
TTC7B-202ENST00000553948 ERCC6Q03468 1493 aa61.24■■■■■ 7.39
TTC7B-202ENST00000553948 NESP48681 1621 aa61.11■■■■■ 7.37
TTC7B-202ENST00000553948 WIZO95785 1651 aa60.95■■■■■ 7.35
TTC7B-202ENST00000553948 CUX2O14529 1486 aa60.91■■■■■ 7.34
TTC7B-202ENST00000553948 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa60.82■■■■■ 7.33
TTC7B-202ENST00000553948 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP60.59■■■■■ 7.29
TTC7B-202ENST00000553948 PDS5BQ9NTI5 1447 aa60.46■■■■■ 7.27
TTC7B-202ENST00000553948 CADPSQ9ULU8 1353 aa60.44■■■■■ 7.27
TTC7B-202ENST00000553948 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP60.37■■■■■ 7.26
TTC7B-202ENST00000553948 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa60.36■■■■■ 7.25
TTC7B-202ENST00000553948 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP60.23■■■■■ 7.23
TTC7B-202ENST00000553948 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa60.17■■■■■ 7.22
TTC7B-202ENST00000553948 MRC2Q9UBG0 1479 aa59.89■■■■■ 7.18
TTC7B-202ENST00000553948 CFTRP13569 1480 aa59.87■■■■■ 7.17
TTC7B-202ENST00000553948 CEP164Q9UPV0 1460 aa59.77■■■■■ 7.16
TTC7B-202ENST00000553948 FANCD2Q9BXW9 1451 aa59.76■■■■■ 7.16
TTC7B-202ENST00000553948 WDR62O43379 1518 aa59.7■■■■■ 7.15
TTC7B-202ENST00000553948 CCDC88BA6NC98 1476 aa59.53■■■■■ 7.12
TTC7B-202ENST00000553948 PRDM2Q13029 1718 aa59.36■■■■■ 7.09
TTC7B-202ENST00000553948 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP59.21■■■■■ 7.07
TTC7B-202ENST00000553948 TOPBP1Q92547 1522 aa58.68■■■■■ 6.98
TTC7B-202ENST00000553948 ABCC8Q09428 1581 aa58.63■■■■■ 6.98
TTC7B-202ENST00000553948 IFT140Q96RY7 1462 aa58.55■■■■■ 6.96
TTC7B-202ENST00000553948 DNMBPQ6XZF7 1577 aa58.54■■■■■ 6.96
TTC7B-202ENST00000553948 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP58.39■■■■■ 6.94
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP58.37■■■■■ 6.93
TTC7B-202ENST00000553948 OSCARQ8IYS5 282 aa58.25■■■■■ 6.92
TTC7B-202ENST00000553948 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP58.12■■■■■ 6.9
TTC7B-202ENST00000553948 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP58.12■■■■■ 6.9
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TTC7B-202ENST00000553948 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP57.93■■■■■ 6.864e-7■■■■■ 29.4
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TTC7B-202ENST00000553948 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa57.89■■■■■ 6.86
TTC7B-202ENST00000553948 CUX1P39880 1505 aa57.89■■■■■ 6.86
TTC7B-202ENST00000553948 FGD5Q6ZNL6 1462 aa57.85■■■■■ 6.85
TTC7B-202ENST00000553948 TRIM41Q8WV44 630 aa57.8■■■■■ 6.84
TTC7B-202ENST00000553948 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP57.68■■■■■ 6.82
TTC7B-202ENST00000553948 WDR97A6NE52 1622 aa57.61■■■■■ 6.81
TTC7B-202ENST00000553948 CHD1O14646 1710 aa57.57■■■■■ 6.81
TTC7B-202ENST00000553948 FBLN2P98095 1184 aa57.46■■■■■ 6.79
TTC7B-202ENST00000553948 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa57.4■■■■■ 6.78
TTC7B-202ENST00000553948 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa57.4■■■■■ 6.78
TTC7B-202ENST00000553948 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa57.4■■■■■ 6.78
TTC7B-202ENST00000553948 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa57.37■■■■■ 6.77
TTC7B-202ENST00000553948 GRIN2BQ13224 1484 aa57.32■■■■■ 6.77
TTC7B-202ENST00000553948 ARHGEF11O15085 1522 aa57.29■■■■■ 6.76
TTC7B-202ENST00000553948 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP57.27■■■■■ 6.76
TTC7B-202ENST00000553948 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa57.24■■■■■ 6.75
TTC7B-202ENST00000553948 GAPVD1Q14C86 1478 aa57.2■■■■■ 6.75
TTC7B-202ENST00000553948 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP57.17■■■■■ 6.74
TTC7B-202ENST00000553948 TOP2BQ02880 1626 aa57.14■■■■■ 6.74
TTC7B-202ENST00000553948 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa57.14■■■■■ 6.74
TTC7B-202ENST00000553948 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP57.14■■■■■ 6.74
TTC7B-202ENST00000553948 PBRM1Q86U86 1689 aa57.14■■■■■ 6.74
TTC7B-202ENST00000553948 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa57.09■■■■■ 6.73
TTC7B-202ENST00000553948 SYNJ1O43426 1573 aa57.08■■■■■ 6.73
TTC7B-202ENST00000553948 SYNJ2O15056 1496 aa57.06■■■■■ 6.72
TTC7B-202ENST00000553948 CLASP1Q7Z460 1538 aa56.9■■■■■ 6.7
TTC7B-202ENST00000553948 CYB5RLQ6IPT4 315 aa56.83■■■■■ 6.69
TTC7B-202ENST00000553948 ARAP1Q96P48 1450 aa56.76■■■■■ 6.68
TTC7B-202ENST00000553948 ADAMTS12P58397 1594 aa56.62■■■■■ 6.65
TTC7B-202ENST00000553948 GRIN2AQ12879 1464 aa56.58■■■■■ 6.65
TTC7B-202ENST00000553948 ERICH3Q5RHP9 1530 aa56.54■■■■■ 6.64
TTC7B-202ENST00000553948 FHAD1B1AJZ9 1412 aa56.49■■■■■ 6.63
TTC7B-202ENST00000553948 NUP160Q12769 1436 aa56.35■■■■■ 6.61
TTC7B-202ENST00000553948 CEP170Q5SW79 1584 aa56.33■■■■■ 6.61
TTC7B-202ENST00000553948 KIF27Q86VH2 1401 aa56.06■■■■■ 6.56
TTC7B-202ENST00000553948 ERCC6L2Q5T890 1561 aa56.05■■■■■ 6.56
TTC7B-202ENST00000553948 SHROOM2Q13796 1616 aa56.04■■■■■ 6.56
TTC7B-202ENST00000553948 TRHP20396 242 aaPredicted RBP56.03■■■■■ 6.56
TTC7B-202ENST00000553948 IGF1RP08069 1367 aa55.93■■■■■ 6.54
TTC7B-202ENST00000553948 CUL7Q14999 1698 aa55.86■■■■■ 6.53
TTC7B-202ENST00000553948 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa55.81■■■■■ 6.52
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